24小时热门版块排行榜    

查看: 1867  |  回复: 9

nmgyxx

新虫 (小有名气)

[求助] 如何把多条序列都转化成他们的反序列?(一共50000条,要求每条都反序)

如何把多条序列都转化成他们的反序列?(一共50000条,要求每条都反序)。例如:ATTTCGCGCCAAAAA转化后为:AAAAACCGCGCTTTA
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 原序列.TXT
  • 2013-11-27 10:37:13, 67.62 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, thanks for posting 2013-11-27 20:07:02
2楼2013-11-27 13:45:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Davidzjy at 2013-11-27 13:45:31
http://emboss.bioinformatics.nl/

EMBOSS是个很实用的工具 其中revseq(左边找)可以将序列倒过来
3楼2013-11-27 13:46:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nmgyxx

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Davidzjy at 2013-11-27 13:46:55
EMBOSS是个很实用的工具 其中revseq(左边找)可以将序列倒过来...

我试了一下出现错误了不知道为什么,麻烦您看看我的附件,可以直接在EMBOSS中上传然后revseq吗?谢谢
4楼2013-11-27 15:08:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by nmgyxx at 2013-11-27 15:08:32
我试了一下出现错误了不知道为什么,麻烦您看看我的附件,可以直接在EMBOSS中上传然后revseq吗?谢谢...

出了什么错误?你不说我怎么知道。。。是不是除了reverse还选了complementary?
5楼2013-11-27 15:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nmgyxx

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Davidzjy at 2013-11-27 15:43:46
出了什么错误?你不说我怎么知道。。。是不是除了reverse还选了complementary?...

麻烦您帮我看一下吧,提交完就这样了
如何把多条序列都转化成他们的反序列?(一共50000条,要求每条都反序)
图片1.jpg

6楼2013-11-27 19:02:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
6楼: Originally posted by nmgyxx at 2013-11-27 19:02:07
麻烦您帮我看一下吧,提交完就这样了

图片1.jpg
...

1. download emboss and install it locally
2. use the online version
3. use galaxy https://usegalaxy.org/ in the left top corner, search revseq
7楼2013-11-27 20:06:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nannan5000

木虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 应助指数-1, 有代码才能算是应助 2013-11-30 00:57:06
俺可以给你写个小程序完成,很简单的
追求卓越
8楼2013-11-28 15:52:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nmgyxx

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by nannan5000 at 2013-11-28 15:52:12
俺可以给你写个小程序完成,很简单的

那麻烦啦,求程序……
9楼2013-11-28 16:52:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aylya025

木虫 (正式写手)

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 谢谢参与,不过回帖更倾向于交流,而不是应助,因为你不知道怎么批量 2013-11-30 00:57:38
wizardfan: 应助指数-1, 上次忘记减应助了 2013-11-30 00:58:02
DNAMAN也可以的,不过批量我就不知道该怎么做了
10楼2013-11-29 16:27:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nmgyxx 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 0703化学调剂 +11 妮妮ninicgb 2026-03-15 15/750 2026-03-21 19:15 by ColorlessPI
[考研] 0805 316求调剂 +3 大雪深藏 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:55 by 学员8dgXkO
[考研] 生物学调剂 +3 Surekei 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:31 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 .m.. 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:25 by barlinike
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +3 NIFFFfff 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:23 by luoyongfeng
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中南化学(0703)总分337求调剂 +8 niko- 2026-03-19 9/450 2026-03-20 21:57 by luoyongfeng
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生(接收计算机专业调剂) +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 求调剂 +3 暗涌afhb 2026-03-16 3/150 2026-03-20 00:28 by 河南大学校友
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
信息提示
请填处理意见