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sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci

[求助] vasp分子动力学报错 已有3人参与

最近开始学习做vasp分子动力学，用实验得到的坐标数据和别人提供的INCAR例子稍作修改后进行计算。

报错如下：

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      VASP found    297 degrees of freedom                                   |
|      the temperature will equal 2*E(kin)/ (degrees of freedom)              |
|      this differs from previous releases, where T was 2*E(kin)/(3 NIONS).   |
|      The new definition is more consistent                                  |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           4 )
reading WAVECAR
prediction of wavefunctions initialized - no I/O
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
RMM:   1     0.764392063216E+04    0.76439E+04   -0.67877E+05   744   0.153E+03
RMM:   2     0.162604293910E+04   -0.60179E+04   -0.16132E+05   744   0.684E+02
RMM:   3     0.355026647917E+04    0.19242E+04   -0.99770E+03   744   0.477E+02
RMM:   4    -0.355257110459E+03   -0.39055E+04   -0.34173E+04  2074   0.368E+02
RMM:   5    -0.556354687631E+03   -0.20110E+03   -0.20557E+03  2181   0.685E+01    0.104E+02
RMM:   6    -0.807969295148E+03   -0.25161E+03   -0.40985E+03  1730   0.976E+01    0.105E+02
RMM:   7    -0.518920100251E+03    0.28905E+03   -0.64031E+02  1489   0.525E+01    0.353E+01
RMM:   8    -0.499452185825E+03    0.19468E+02   -0.83667E+01  1584   0.143E+01    0.153E+01
RMM:   9    -0.503489505756E+03   -0.40373E+01   -0.90584E+01  1512   0.131E+01    0.286E+01
RMM:  10    -0.496681907434E+03    0.68076E+01   -0.12014E+01  1574   0.532E+00    0.127E+01
RMM:  11    -0.494480696413E+03    0.22012E+01   -0.59178E+00  1503   0.397E+00    0.362E+00
RMM:  12    -0.494307140858E+03    0.17356E+00   -0.97898E-01  1544   0.131E+00    0.170E+00
RMM:  13    -0.494289008337E+03    0.18133E-01   -0.26473E-01  1628   0.610E-01    0.150E+00
RMM:  14    -0.494254078873E+03    0.34929E-01   -0.10911E-01  1551   0.494E-01    0.679E-01
RMM:  15    -0.494248439290E+03    0.56396E-02   -0.26568E-02  1536   0.246E-01    0.438E-01
RMM:  16    -0.494246774664E+03    0.16646E-02   -0.89946E-03  1457   0.138E-01    0.310E-01
RMM:  17    -0.494245830769E+03    0.94389E-03   -0.40946E-03  1375   0.905E-02    0.165E-01
RMM:  18    -0.494245656830E+03    0.17394E-03   -0.10657E-03  1378   0.426E-02    0.116E-01
RMM:  19    -0.494245540146E+03    0.11668E-03   -0.65529E-04  1240   0.436E-02    0.581E-02
RMM:  20    -0.494245488923E+03    0.51223E-04   -0.12036E-04   865   0.199E-02  
1 T=    NaN E=  NaN           F= -.49424549E+03 E0= -.49424406E+03  EK=  NaN     
   SP= 0.00E+00 SK=  NaN bond charge predicted
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
Job  /jobmgr/lsf8.0/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/intelmpi_wrapper -np 12 /apps/soft/vasp/vasp.5.2/vasp.5.2/vasp
TID   HOST_NAME   COMMAND_LINE            STATUS            TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================00000 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00001 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00002 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00003 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00004 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00005 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00006 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00007 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00008 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00009 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00010 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00011 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
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夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花
1楼 2013-11-26 17:27:16
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sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci
这是INCAR
Zr53 MD
# start parameters
   NWRITE = 2
   ISTART = 0
   ICHARG = 2
   ENCUT = 380


#Electroic  Relaxation
   PREC  = Medium
   NELM =  150
   NELMDL = 5
   EDIFF = 1.0e-4
   LREAL =  auto


#Ionic relaxation
  NSW  =  900
  IBRION  =  0
  ISIF      =   0
  ISYM    =   0
  ISMAR  =  1
  SIGMA  =  0.1
IALGO  =  48
  LDIAG  =  T
  VOSKOWN = 1
  NGX = 78
  NGY = 74
  NGZ = 78


# MD flags
  SMASS  =  2
  POTIM  =  2
  TEBEG  = 400
  TEEND  = 400

#Write flags
  LWAVE =    F
  LCHARG =  F
  LVTOT  =   F
  LELF   =    F
  LORBIT =  F


这是POSCAR部分数据
Cu64Zr36
   1.00000000000000
    12.0000000000000000    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000   11.8000000000000007    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   12.5000000000000000
   Cu   Zr
  64  36
Direct
  0.0445316012624346  0.8767680807860145  0.6543323012345823
  0.0612530510210334  0.5975315534439858  0.2762958886825047
  0.0621291046130281  0.8904940274270459  0.4368290639755159
  0.0637359446944004  0.1744694999170520  0.8685319037139934
  0.0812315172936593  0.2980550432761078  0.5168033781711330
  0.1084071158034305  0.6662314568253791  0.5056049433440037
  0.1344183616036290  0.3962247685368325  0.3367521396043429
  0.1471929769311657  0.7068228518304380  0.9628619945375689
  0.1617505579197100  0.2573339277376760  0.1724685513823090
  0.1669119948037405  0.6910890948599757  0.1340729096298503
  0.1932835613752673  0.4156836164572724  0.6676752363990417
  0.2244594204021482  0.8978810500978298  0.1344598214099051
  0.2250764654001998  0.2997802501499507  0.9128368076884499
  0.2389981702790394  0.0355756381307657  0.5641253099168893
  0.2508580642317213  0.8239284177063908  0.7989103058139762
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夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花
2楼2013-11-26 17:29:31
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sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci
有哪位大能知道我哪儿错了吗？
我NSW=900，1000,3000；POTIM=3,5；SMASS=0,1,2,3都试过了

原子位置根本就不动
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夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花
3楼2013-11-26 17:31:52
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snail594

金虫 (小有名气)
建议先按手册后面的MD部分的参数设置，参数越少，错误也就越少。之后再按照自己需要一步步添加部分参数设置。
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Inlearningwetrust
4楼2013-11-26 17:53:09
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sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci
好吧，简化INCAR后还是出现同样错误，简化后的INCAR如下
Zr53 MD
# start parameters
   ISTART = 0
   ICHARG = 2
   ENCUT = 380

#Electroic  Relaxation
   PREC  = Medium
   NELM =  150
   EDIFF = 1.0e-4
   LREAL =  auto


#Ionic relaxation
  NSW  =  900
  IBRION  =  0
  ISIF      =   0
  ISYM    =   0
  ISMAR  =  1
  SIGMA  =  0.1
  IALGO  =  48
  VOSKOWN = 1
  NGX = 78
  NGY = 74
  NGZ = 78


# MD flags
  SMASS  =  2
  POTIM  =  2
  TEBEG  = 400
  TEEND  = 400

#Write flags
  LWAVE =    F
  LCHARG =  F
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5楼2013-11-26 19:01:12
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sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci
现在报错  REAL_OPT: internal ERROR:          -8         -16          -8          52

INCAR如下，应该不能再简化了吧
   ISTART = 0
   ICHARG = 2
   ENCUT = 380
   EDIFF = 1.0e-4
   LREAL =  auto

#Ionic relaxation
  NSW  =  900
  IBRION  =  0
  ISIF      =   0
  ISYM    =   0
  ISMAR  =  1
  SIGMA  =  0.1
  IALGO  =  48

# MD flags
  SMASS  =  2
  POTIM  =  2
  TEBEG  = 400
  TEEND  = 400
  LWAVE =    F
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夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花
6楼2013-11-26 19:14:26
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sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci
没人知道吗？
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夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花
7楼2013-11-27 15:43:30
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wl405103906

木虫 (初入文坛)

菜鸟
楼主你的问题解决了吗？我也出现这种问题，尝试修改参数，都不行。我做的是分子动力学。
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vasp
8楼2014-01-03 15:35:17
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零下1℃

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-03 21:55:53
建议楼主将IBRION设置为3试一下。当IBRION=3时，适应于分子动力学计算，原子原始坐标位置不是很准确的时候。希望能够有帮助。
赞一下 回复此楼
9楼2014-01-03 15:59:37
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sxjsn1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wl405103906 at 2014-01-03 15:35:17
楼主你的问题解决了吗？我也出现这种问题，尝试修改参数，都不行。我做的是分子动力学。

没。。。
10楼2014-01-03 20:47:27
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[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
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[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
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