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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】L9999报错
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Hansongtao

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[交流] 【求助】L9999报错 已有4人参与

以下是我的半乳糖优化兼频率计算的输入文件和报错的输出文件。报错原因是L9999，我该如何解决？是因为输入结构不够对称吗？

输入文件如下：
%chk=D:\Doctor_Paper\Calculation3\Banrutang\hao\Banrutang_C2OH.chk
# opt freq uam1

[No Title]

0 2
C                 -2.44824933    0.73814285    1.19214715
C                 -2.16346582   -1.05487306    2.07752678
C                 -1.11701034   -0.39154427    2.96333682
C                  0.09442221    0.23959788    2.28981735
O                 -0.36128589    2.14054897    1.47669675
C                 -1.11106689    1.26046545    0.68355489
O                  0.52789754   -0.57020541    1.23063936
H                  1.24188637    0.38522751    3.28058690
H                 -1.60190831    0.51455690    4.08724102
O                 -1.09677695   -1.77436927    3.19369603
O                 -3.21790704   -1.52528582    2.87277605
H                 -1.53070906   -2.22130573    1.33019442
H                 -3.38124013    0.49908733    0.01231212
O                 -3.02021941    1.68154869    2.05731614
C                 -0.86137632    2.75359947    0.51662773
H                 -0.45937279    0.24812328   -0.24910373
O                 -0.63152109    4.12811941    0.36296120
H                  1.27232613   -0.31195240    0.71448233
H                 -3.05197873   -2.16337037    3.54564154
H                 -3.21819077    2.54799278    1.74501895
H                 -0.30775782    2.76895445    1.48202182
H                 -1.21214326    2.74387071   -0.09503594
H                 -0.88807605    4.72739444    1.04299039



报错的输出文件最后一部份内容：
Mulliken atomic spin densities:
              1
     1  C   -0.003493
     2  C    0.088758
     3  C   -0.139564
     4  C    0.993396
     5  O   -0.112727
     6  C   -0.005551
     7  O    0.109649
     8  H   -0.049910
     9  H    0.144168
    10  O    0.913265
    11  O   -0.001010
    12  H   -0.002080
    13  H   -0.035640
    14  O   -0.018459
    15  C   -0.826709
    16  H    0.006269
    17  O   -0.064242
    18  H    0.000522
    19  H    0.002636
    20  H    0.001544
    21  H    0.006563
    22  H    0.002639
    23  H   -0.010023
Sum of Mulliken spin densities=   1.00000


    WHAT WE HAVE LEARNED
IS LIKE A HANDFUL OF EARTH;
  WHAT WE HAVE YET TO LEARN
   IS LIKE THE WHOLE WORLD.

         -- AVVAYIAR
Error termination request processed by link 9999.
Error termination via Lnk1e in e:\Gaussian03\l9999.exe at Tue Jun 15 07:13:26 2010.
Job cpu time:  0 days  0 hours 11 minutes 16.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     11 Int=      0 D2E=      0 Chk=      5 Scr=      1
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1楼 2010-06-15 07:25:48
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1.换个基组
2.将结构导出，计算算
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2楼2010-06-15 08:47:19
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):敬业！！ 2010-06-15 15:30:28
看了你的初始计算文件，我无奈了
你在你的GaussView面板上点击菜单view--display format--general--show lables
这样就能调出你的原子编号，咱们看看：
你的1号碳和2号碳之间应该是单键相连的，但是你这里却远离超过了2埃，这也太离谱了。
5号氧和21号氢之间却只有0.6埃，根本不可能
同样是sp3杂化碳上的氢，2号碳和12号氢之间距离高达1.5埃，而15号碳和22号氢之间的距离仅为0.7埃，这不是扯的么……您故意给高斯找别扭是吧
初始结构很重要

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-15 at 15:00 ]
赞一下(3人) 回复此楼
3楼2010-06-15 12:39:26
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

我给你一个初始结构吧，半乳糖的分子结构我不清楚，在谷歌上查的分子结构一并附上

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):敬业！！ 2010-06-15 15:30:35
# hf/3-21g

Title Card Required

0 1
C                 -0.19802476   -1.76874343    1.04467349
C                  0.54996309   -1.57389564   -0.27813297
C                  0.34553712   -0.14065644   -0.77095009
C                  0.74603898    0.80305749    0.36820498
C                 -0.42555074   -0.70791200    1.86686636
H                  0.95821069    0.02353860   -1.63267573
H                  1.59316149   -1.73776154   -0.10554949
H                  1.73606923    0.56273733    0.69529263
O                 -0.19411707    0.65327562    1.44694957
C                  0.70952330    2.26352741   -0.11892359
H                  0.98460519    2.91447231    0.68450698
H                  1.39747435    2.38656864   -0.92916072
O                 -0.61142816    2.58528535   -0.56216064
H                 -0.63419118    3.49570815   -0.86582521
O                 -1.02279651    0.09113886   -1.11567320
H                 -1.28153261   -0.50849964   -1.81929902
O                  0.07818993   -2.49965313   -1.26063140
H                  0.21502130   -3.39658357   -0.94695486
H                 -0.79867461   -0.88846211    2.85331465
H                 -0.53385126   -2.74435605    1.32804705


在谷歌上查的“D-半乳糖”的分子结构

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-15 at 12:50 ]
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4楼2010-06-15 12:49:15
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Hansongtao

捐助贵宾 (小有名气)

感激大家的帮助

感激大家的答复，感激大家的帮助！
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5楼2010-06-16 08:52:46
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鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填
★ ★
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heyo_123(金币+1):？？？你是？？？ 2010-06-16 09:50:05
像区长那样，把你的分子结构直接上传吧
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己所不欲，勿施于人；己所欲者，亦勿施人。无论穷达，但守本分；八风不动，独善自身。
6楼2010-06-16 09:49:07
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Hansongtao

捐助贵宾 (小有名气)

三种单糖的分子结构


这是我要计算的半乳糖分子的chemdraw图像

这是我要计算的甘露糖分子的chemdraw图像

这是我要计算的葡萄糖分子的chemdraw图像

另外，我始终对正确的初始结构的建立没有搞明白。以我计算键能的葡萄糖为例，我是经过这样几个步骤：
1。在课本上看到葡萄糖的结构，其中重要的结构特征是直立健和平伏健的差别
2。用chemdraw将上述结构画出来，其中直立键和平伏键就是通过目测，感觉相对环平面是直立或平伏就行了。（这样做行吗？）
3。转送结构至chem3D
4。用chem3D创建输入文件，用gaussian计算。
大家可以看出这个过程，只有通过目测保证键的直立或平伏，这样是不是太不保险了？

[ Last edited by Hansongtao on 2010-6-16 at 10:17 ]
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7楼2010-06-16 10:16:38
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heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-06-16 17:28:17
引用回帖:
Originally posted by Hansongtao at 2010-06-16 10:16:38:

这是我要计算的半乳糖分子的chemdraw图像

这是我要计算的甘露糖分 ...

你的糖都好诡异的说……大概你把很多H都给取代成了甲基了？我怀疑你画错了
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2010-06-16 14:22:24
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