版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (1526)
>考研 (113)
>导师招生 (96)
>虫友互识 (67)
>基金申请 (34)
>休闲灌水 (18)
>硕博家园 (17)
>博后之家 (13)
>论文投稿 (11)
>微米和纳米 (10)
>教师之家 (10)
>考博 (8)
>找工作 (8)
>经济学 (6)
>文献求助 (6)
>公派出国 (6)

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci

应助: 5 (幼儿园)
金币: 1108
散金: 165
红花: 4
帖子: 238
在线: 101小时
虫号: 941839
注册: 2010-01-13
性别: GG
专业: 金属非晶态、准晶和纳米晶

[求助] vasp分子动力学报错已有3人参与

最近开始学习做vasp分子动力学，用实验得到的坐标数据和别人提供的INCAR例子稍作修改后进行计算。

报错如下：

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                            |
|          W W AA RRRRR N N  II  N N GGGG !!!          |
|          W W A  A R R  NN N  II  NN N  G G  !!!          |
|          W W  A A  R R  N N  N  II  N N  N  G    !!!          |
|          W WW W  AAAAAA  RRRRR N  N N  II  N  N N  G  GGG !          |
|          WW  WW  A A  R R N NN  II  N NN  G G             |
|          W W  A A  R R  N N  II  N N GGGG !!!          |
|                                                                            |
|    VASP found 297 degrees of freedom                                  |
|    the temperature will equal 2*E(kin)/ (degrees of freedom)             |
|    this differs from previous releases, where T was 2*E(kin)/(3 NIONS). |
|    The new definition is more consistent                               |
|                                                                            |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(          4 )
reading WAVECAR
prediction of wavefunctions initialized - no I/O
entering main loop
   N    E                   dE          d eps    ncg    rms       rms(c)
RMM: 1    0.764392063216E+04 0.76439E+04 -0.67877E+05 744 0.153E+03
RMM: 2    0.162604293910E+04 -0.60179E+04 -0.16132E+05 744 0.684E+02
RMM: 3    0.355026647917E+04 0.19242E+04 -0.99770E+03 744 0.477E+02
RMM: 4 -0.355257110459E+03 -0.39055E+04 -0.34173E+04  2074 0.368E+02
RMM: 5 -0.556354687631E+03 -0.20110E+03 -0.20557E+03  2181 0.685E+01 0.104E+02
RMM: 6 -0.807969295148E+03 -0.25161E+03 -0.40985E+03  1730 0.976E+01 0.105E+02
RMM: 7 -0.518920100251E+03 0.28905E+03 -0.64031E+02  1489 0.525E+01 0.353E+01
RMM: 8 -0.499452185825E+03 0.19468E+02 -0.83667E+01  1584 0.143E+01 0.153E+01
RMM: 9 -0.503489505756E+03 -0.40373E+01 -0.90584E+01  1512 0.131E+01 0.286E+01
RMM:  10 -0.496681907434E+03 0.68076E+01 -0.12014E+01  1574 0.532E+00 0.127E+01
RMM:  11 -0.494480696413E+03 0.22012E+01 -0.59178E+00  1503 0.397E+00 0.362E+00
RMM:  12 -0.494307140858E+03 0.17356E+00 -0.97898E-01  1544 0.131E+00 0.170E+00
RMM:  13 -0.494289008337E+03 0.18133E-01 -0.26473E-01  1628 0.610E-01 0.150E+00
RMM:  14 -0.494254078873E+03 0.34929E-01 -0.10911E-01  1551 0.494E-01 0.679E-01
RMM:  15 -0.494248439290E+03 0.56396E-02 -0.26568E-02  1536 0.246E-01 0.438E-01
RMM:  16 -0.494246774664E+03 0.16646E-02 -0.89946E-03  1457 0.138E-01 0.310E-01
RMM:  17 -0.494245830769E+03 0.94389E-03 -0.40946E-03  1375 0.905E-02 0.165E-01
RMM:  18 -0.494245656830E+03 0.17394E-03 -0.10657E-03  1378 0.426E-02 0.116E-01
RMM:  19 -0.494245540146E+03 0.11668E-03 -0.65529E-04  1240 0.436E-02 0.581E-02
RMM:  20 -0.494245488923E+03 0.51223E-04 -0.12036E-04 865 0.199E-02
1 T= NaN E=  NaN          F= -.49424549E+03 E0= -.49424406E+03  EK=  NaN
SP= 0.00E+00 SK=  NaN bond charge predicted
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
REAL_OPT: internal ERROR:       -48       -48       -48       32
Job  /jobmgr/lsf8.0/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/intelmpi_wrapper -np 12 /apps/soft/vasp/vasp.5.2/vasp.5.2/vasp
TID HOST_NAME COMMAND_LINE          STATUS          TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================00000 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00001 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00002 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00003 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00004 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00005 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00006 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00007 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00008 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00009 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00010 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30
00011 c19b15    /apps/soft/vasp/  Done                   11/26/2013 16:48:30

回复此楼

» 猜你喜欢

求调剂院校信息已经有4人回复
085600材料与化工306 已经有4人回复
286求调剂已经有10人回复
328求调剂，英语六级551，有科研经历已经有9人回复
一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂已经有4人回复
286分人工智能专业请求调剂愿意跨考！已经有8人回复
资源与环境调剂申请(333分) 已经有5人回复
280求调剂已经有12人回复
269专硕求调剂已经有5人回复
材料学硕301分求调剂已经有7人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

分子动力学能量守恒的相关问题已经有18人回复
关于MS动力学精度设置问题已经有4人回复
vasp编译错误求助已经有6人回复
求INCAR里各个参数的中文意义已经有3人回复
NPT系综动力学已经有19人回复
vasp并行编译通过，运行却出现错误提示已经有5人回复
有没有人用Amber做过膜蛋白动力学模拟已经有14人回复
VASP报错：VERY BAD NEWS! 已经有5人回复
VASP分子动力学优化的INCAR如下，怎么CONTCAR和POSCAR没有什么变化啊？已经有13人回复
【求助】VASP做分子动力学模拟NVT系综下为啥内能竟然是升高的？已经有8人回复
【任务征集】VASP跑分子动力学数据处理方法已经有20人回复
【求助】vasp报错，WARNING in EDDRMM 已经有13人回复
【求助】编译过程没有报错，运行vasp提示找不到libmkl_intel_lp64.so 已经有6人回复
【活动】vasp计算分子动力学讨论合集及专贴（筹划中）已经有33人回复
【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助已经有12人回复
【求助】请教vasp计算恒温第一原理分子动力学已经有9人回复
【求助】vasp用neb计算过渡态报错，错误提示是什么意思？已经有9人回复
【求助】L9999报错已经有7人回复
【求助】vasp分子动力学模拟求助已经有15人回复
【求助】vasp编译时，报错：cannot find -lmkl_em64t 已经有11人回复
【原创】vasp的分子动力学模拟已经有44人回复

夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花

1楼 2013-11-26 17:27:16

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wl405103906

木虫 (初入文坛)

菜鸟

应助: 0 (幼儿园)
金币: 2029
帖子: 23
在线: 72.6小时
虫号: 2415028
注册: 2013-04-12
性别: MM
专业: 原子和分子物理

楼主你的问题解决了吗？我也出现这种问题，尝试修改参数，都不行。我做的是分子动力学。

赞一下

回复此楼

vasp

8楼2014-01-03 15:35:17

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 17 个回答

sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci

应助: 5 (幼儿园)
金币: 1108
散金: 165
红花: 4
帖子: 238
在线: 101小时
虫号: 941839
注册: 2010-01-13
性别: GG
专业: 金属非晶态、准晶和纳米晶

这是INCAR
Zr53 MD
# start parameters
NWRITE = 2
ISTART = 0
ICHARG = 2
ENCUT = 380

#Electroic  Relaxation
PREC  = Medium
NELM =  150
NELMDL = 5
EDIFF = 1.0e-4
LREAL =  auto

#Ionic relaxation
  NSW  =  900
  IBRION  =  0
  ISIF    = 0
  ISYM = 0
  ISMAR  =  1
  SIGMA  =  0.1
IALGO  =  48
  LDIAG  =  T
  VOSKOWN = 1
  NGX = 78
  NGY = 74
  NGZ = 78

# MD flags
  SMASS  =  2
  POTIM  =  2
  TEBEG  = 400
  TEEND  = 400

#Write flags
  LWAVE = F
  LCHARG =  F
  LVTOT  = F
  LELF = F
  LORBIT =  F

这是POSCAR部分数据
Cu64Zr36
1.00000000000000
12.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000
   0.0000000000000000 11.8000000000000007 0.0000000000000000
   0.0000000000000000 0.0000000000000000 12.5000000000000000
Cu Zr
  64  36
Direct
  0.0445316012624346  0.8767680807860145  0.6543323012345823
  0.0612530510210334  0.5975315534439858  0.2762958886825047
  0.0621291046130281  0.8904940274270459  0.4368290639755159
  0.0637359446944004  0.1744694999170520  0.8685319037139934
  0.0812315172936593  0.2980550432761078  0.5168033781711330
  0.1084071158034305  0.6662314568253791  0.5056049433440037
  0.1344183616036290  0.3962247685368325  0.3367521396043429
  0.1471929769311657  0.7068228518304380  0.9628619945375689
  0.1617505579197100  0.2573339277376760  0.1724685513823090
  0.1669119948037405  0.6910890948599757  0.1340729096298503
  0.1932835613752673  0.4156836164572724  0.6676752363990417
  0.2244594204021482  0.8978810500978298  0.1344598214099051
  0.2250764654001998  0.2997802501499507  0.9128368076884499
  0.2389981702790394  0.0355756381307657  0.5641253099168893
  0.2508580642317213  0.8239284177063908  0.7989103058139762

赞一下

回复此楼

夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花

2楼2013-11-26 17:29:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci

应助: 5 (幼儿园)
金币: 1108
散金: 165
红花: 4
帖子: 238
在线: 101小时
虫号: 941839
注册: 2010-01-13
性别: GG
专业: 金属非晶态、准晶和纳米晶

有哪位大能知道我哪儿错了吗？
我NSW=900，1000,3000；POTIM=3,5；SMASS=0,1,2,3都试过了

原子位置根本就不动

赞一下

回复此楼

夜半酒醒人去后，更持红烛赏残花

3楼2013-11-26 17:31:52

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

snail594

金虫 (小有名气)

1ST强帖: 1
应助: 24 (小学生)
金币: 725.1
红花: 4
帖子: 189
在线: 118.2小时
虫号: 745589
注册: 2009-04-10
性别: GG
专业: 金属材料

建议先按手册后面的MD部分的参数设置，参数越少，错误也就越少。之后再按照自己需要一步步添加部分参数设置。

赞一下

回复此楼

Inlearningwetrust

4楼2013-11-26 17:53:09

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 17 个回答

最具人气热帖推荐 [查看全部]		作者	回/看	最后发表

[考研] 化学工程321分求调剂 +18	大米饭！ 2026-03-15	22/1100	2026-03-21 20:20 by HH领袖
[考研] 296求调剂 +4	www_q 2026-03-20	4/200	2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 268求调剂 +9	简单点0 2026-03-17	9/450	2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 330求调剂0854 +3	assdll 2026-03-21	3/150	2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3	1911236844 2026-03-17	3/150	2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3	Ma_xt 2026-03-17	3/150	2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华南师大 070300（化学）304分求调剂 +3	0703武芊慧雪304 2026-03-18	3/150	2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5	冬十三 2026-03-18	5/250	2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4	一志愿京区211 2026-03-18	6/300	2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9	Doleres 2026-03-19	9/450	2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11	adaie 2026-03-19	11/550	2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3	葵梓卫队 2026-03-20	3/150	2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 0856调剂，是学校就去 +8	sllhht 2026-03-19	9/450	2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +5	1孙悟空 2026-03-17	6/300	2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 344求调剂 +6	knight344 2026-03-16	7/350	2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦 +3	Eember. 2026-03-17	9/450	2026-03-18 10:28 by Eember.
[考博] 26博士申请 +3	1042136743 2026-03-17	3/150	2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[硕博家园] 湖北工业大学生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3	1喜春8 2026-03-17	5/250	2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 考研调剂 +3	淇ya_~ 2026-03-17	5/250	2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3	尖角小荷 2026-03-16	6/300	2026-03-16 23:21 by 尖角小荷

24小时热门版块排行榜

sxjsn1

[求助] vasp分子动力学报错 已有3人参与

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

wl405103906

sxjsn1

sxjsn1

snail594

[求助] vasp分子动力学报错已有3人参与