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aylixmut

铜虫 (小有名气)

[求助] vasp并行编译通过,运行却出现错误提示

vasp并行编译通过,但是在运行的时候出现错误提示是:
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
mpiexec: Warning: tasks 0-7 exited with status 127.

该怎么办,请帮忙,谢谢!
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aylixmut

铜虫 (小有名气)

个人认为是
BLAS=-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_blacs_intelmpi_ilp64 -lpthread
中未加上 -lguide 参数,
但是我在集群系统未找到libguide.so库,怎么办,有没其他代替的。谢谢!
2楼2012-07-18 17:52:35
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lonewolf659

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2012-07-19 23:10:16
并不是你编译的时候没有指定libguide库。而是你运行vasp时,可执行文件链接不到这个库。这种情况需要修改环境变量,在bash中,输入
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/(libguide库的路径)/
不过你的情况不一样,估计你使用的mkl版本较高,已经不提供libguide这个库了。intel网站上有过说明“Since the Intel IPP® 6.0 and Intel® MKL 10.1, the OpenMP libraries ( also called Threading Runtime Libraries) are switching from the legacy OpenMP* run-time library (libguide*) to the compatibility library (libiomp*).”。
按道理说,你在编译的时候就会因为找不到这个库而报错终止了。现在比较可行的办法是重新编译vasp,将libguide库改成libomp*。(具体的名字在mkl里面找找看)
差距,差距啊!
3楼2012-07-19 11:05:34
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aylixmut

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lonewolf659 at 2012-07-19 11:05:34
并不是你编译的时候没有指定libguide库。而是你运行vasp时,可执行文件链接不到这个库。这种情况需要修改环境变量,在bash中,输入
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/(libguide库的路径)/
不过你的情况不 ...

谢谢回复,后来我在另外一路径,比如/opt/intel/Compiler/11.1/lib/intel64下找到了libguide库,加上路径编辑通过,运行还是同样的问题。
今天把lguide 换成libiomp5,编译,编译通过,运行也是同样的问题。

现在有个问题就是为什么系统里的intel库总是会有好几个。路径不一样,比如我要用的libguide.so、libiomp5.so在/opt/intel/Compiler/11.1/lib/intel64下,而比如说libmkl_intel_lp64,libmkl_intel_core,libmkl_intel_thread 却在/opt/intel/Compiler/11.1/mkl/ib/em64t 下。弄得在编译的时候路径要写很多。按您说的在.bash_profile里加入libguide.so路径,(export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH),结果libmkl_intel_lp64.so就找不到了,再加上libmkl_intel_lp64.so路径,结果libguide.so又找不到。郁闷得不了。
4楼2012-07-19 21:38:29
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aylixmut

铜虫 (小有名气)

成功了,我叫我们管理员把库文件都拷在一起就可以了。
谢谢您,学到了不少的知识。
5楼2012-07-20 08:25:20
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yuzy92

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by aylixmut at 2012-07-20 08:25:20
成功了,我叫我们管理员把库文件都拷在一起就可以了。
谢谢您,学到了不少的知识。

前辈你好,我现在也遇到了这样的情况编译的时候还好,运行vasp的时候就error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such file or directory。请问您是吧libguide.so文件跟哪个库拷到一起?
我的libguide.so 文件在opt/intel/Compiler/11.1/046/lib/intel64/  路径下面
求指点
6楼2015-05-04 09:29:34
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