24小时热门版块排行榜    

查看: 1818  |  回复: 5

souledge

专家顾问 (著名写手)

[求助] 使用PGI编译VASP中无法使用长数组

使用PGI最新的12.3 Workstation版(2周试用许可证),MPICH2(configure OpenMPI时出错失败~),编译了VASP 4.6.28。
把makefile.linux_pg_opt稍微修改一下,最关键的是修改处理器类型,去掉-i8,就可以成功编译VASP了,结果没有问题。
但是看到pgif90的帮助文件上有参数:
-Mlarge_arrays
  -Mnolarge_arrays (default) (linux86-64 only). Allow (don't allow) arrays larger than 2GB;
  -Mlarge_arrays is default with -mcmodel=medium.

想到使用ifort时,如果不使用-heap-arrays,就会在计算大体系时容易内存溢出然后停止计算,于是也就在PGI的编译上使用了-Mlarge_arrays,结果,计算哪怕是个非常简单的结构时,也会在reading WAVECAR后出现错误:
internal ERROR: SETYLM, insufficient INDMAX workspace
比较郁闷和搞笑的是,这个错误在VASP的官方论坛里看,是使用ifort编译的,并且解决方案恰恰就是添加-heap-arrays……
于是实在想不出解决方法来了,来看看大家有什么解决方案没……
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

思想重于技巧,内涵重于表象
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

thinkllh

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖交流! 2012-04-03 23:31:59
如此,何不直接用ifort, 还 不 存在 2周 试用 的 问 题.
Thinkwiththeworld.
2楼2012-04-03 22:58:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)


fzx2008: 金币+1, 赞! 2012-04-03 23:32:14
引用回帖:
2楼: Originally posted by thinkllh at 2012-04-03 22:58:13:
如此,何不直接用ifort, 还 不 存在 2周 试用 的 问 题.

考虑到在很多大型机上使用的是PGI或者Pathscale,为了防止今后万一有机会碰上时太抓瞎~
思想重于技巧,内涵重于表象
3楼2012-04-03 23:28:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)


贺仪: 金币+1, 谢谢参与讨论 2012-04-04 13:26:37
新的一个测试结果,计算一个64个原子的四方对称模型,单核运行没有使用-Mlarge_arrays编译的VASP,居然占用内存6GB,并且没有出错。等待了半个小时,出现了第一个SCF步~不继续等了~先发一个运行中的资源截图。是否这意味着使用PGI的话无需考虑传说中的2GB数组限制问题呢?
思想重于技巧,内涵重于表象
4楼2012-04-04 00:02:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绿遍山原

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教 2012-04-04 18:08:11
souledge: 金币+20, ★★★★★最佳答案, Puts automatic arrays and arrays created for temporary computations on the heap instead of the stack. 2012-04-04 19:38:51
一般不会有哪个程序一次allocate2GB的数组。heap-array是为了把内存申请从栈上移到堆上。
要夢遊,不要催眠。
5楼2012-04-04 17:55:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 绿遍山原 at 2012-04-04 17:55:12:
一般不会有哪个程序一次allocate2GB的数组。heap-array是为了把内存申请从栈上移到堆上。

看了一下manual,以前的理解有点误区~
思想重于技巧,内涵重于表象
6楼2012-04-04 19:39:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 souledge 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +5 zju2000 2026-08-16 5/250 2026-08-16 23:23 by Haru815
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见