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maoshanjun

新虫 (正式写手)

[交流] vasp 编译专用的可执行文件 已有2人参与

vasp怎 么 编译 gamma 点 , 多 kpoints, vtst, vdW等专用 的 可 执行 文件?
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
maoshanjun: 金币+10, 万分感谢啊 2014-08-07 08:31:16
makefile 啥都沒改~就是 complex version (也就是一般版本,任何K點都適用,vdW 也適用)

將 CPP 的 -DNGZhalf (或 -DNGXhalf) 改成 -DwNGZhalf (或 -DwNGXhalf) 就是 gamma version

將 CPP 的 -DNGZhalf (或 -DNGXhalf) 拿掉,就是 non-collinear 版本

vtst 版本要上 vtst 網站下載 source code 加入 VASP source code 重編即可
3楼2014-08-05 18:12:00
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jpchou

专家顾问 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
???????

Gamma version ?????
?????? CPP ?? -DNGZhalf
??? -DNGZhalf -DwNGZhalf

?@????????????r???????Ч
?????г??F -DwNGZhalf
????????????? VASP ?? OUTCAR ??????????f?@?? gamma version
?????H??Ч??]????????
??~???Щ???????F???} (ex: HSE06)
5楼2014-08-13 04:43:42
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普通回帖
2楼2014-08-04 21:08:45
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maoshanjun

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jpchou at 2014-08-05 18:12:00
makefile 啥都沒改~就是 complex version (也就是一般版本,任何K點都適用,vdW 也適用)

將 CPP 的 -DNGZhalf (或 -DNGXhalf) 改成 -DwNGZhalf (或 -DwNGXhalf) 就是 gamma version

將 CPP 的 -DNGZhalf (或  ...

4楼2014-08-07 08:31:35
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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5楼: Originally posted by jpchou at 2014-08-13 04:43:42
修正一下

Gamma version 的編法
應該是將 CPP 的 -DNGZhalf
改成 -DNGZhalf -DwNGZhalf

這兩個參數都要同時存在才有效
如果只有出現 -DwNGZhalf
編會編成功,跑 VASP 在 OUTCAR 內也會跟你說這是 gamma ...

请问两个tag需要挨着吗?顺序是否有要求?
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
6楼2014-08-13 08:36:01
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jpchou

专家顾问 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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6楼: Originally posted by magicmonk at 2014-08-13 08:36:01
请问两个tag需要挨着吗?顺序是否有要求?...

沒有研究順序是否有影響
但這兩個 tag 中間是有空格
7楼2014-08-13 15:33:17
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by jpchou at 2014-08-13 15:33:17
沒有研究順序是否有影響
但這兩個 tag 中間是有空格...

噢噢,那是当然的还想问一下,我按照manual上的说明编译了一个advanced MD版本的VASP,就加入-Dtbdyn,但是测试的时候发现跑了几步就卡住不动了,没有任何报错,但任务还显示在run,不知您是否知道原因?
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
8楼2014-08-13 15:40:01
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jpchou

专家顾问 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by magicmonk at 2014-08-13 15:40:01
噢噢,那是当然的还想问一下,我按照manual上的说明编译了一个advanced MD版本的VASP,就加入-Dtbdyn,但是测试的时候发现跑了几步就卡住不动了,没有任何报错,但任务还显示在run,不知您是否知道原因?...

"卡住" 這件事~很難處理
太多種可能

也許是記憶體不足
> 嘗試 login 到執行端,用 free 看記憶體是否被吃光光
> 或是先用較小的系統(或是較粗的參數) 測試 VASP 是否能正常運作

也許是硬碟負載過大,導致 IO 效率太差
> 觀察是否有人在 server 端傳檔案,或是檢測硬碟是否正常運作

也許 VASP 沒有編好
> 同第一點,先用小系統測看看是否正常

也許 VASP advanced MD 計算本?砭褪沁@麼慢 ??!!
> 詳讀手冊,或是上 vasp forum 看看是否有人遇到同樣問題
9楼2014-08-13 16:01:10
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by jpchou at 2014-08-13 16:01:10
"卡住" 這件事~很難處理
太多種可能

也許是記憶體不足
> 嘗試 login 到執行端,用 free 看記憶體是否被吃光光
> 或是先用較小的系統(或是較粗的參數) 測試 VASP 是否能正常運作

也許是硬 ...

感谢您的耐心解答
最后想问一下,您上面所说的Gamma Version-VASP对应的KPOINTS文件是否必须是只取一个gamma点,还是说只要是Gmma centered就可以?
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
10楼2014-08-13 19:56:37
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