24小时热门版块排行榜    

查看: 1934  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

[求助] 使用PGI编译VASP中无法使用长数组

使用PGI最新的12.3 Workstation版(2周试用许可证),MPICH2(configure OpenMPI时出错失败~),编译了VASP 4.6.28。
把makefile.linux_pg_opt稍微修改一下,最关键的是修改处理器类型,去掉-i8,就可以成功编译VASP了,结果没有问题。
但是看到pgif90的帮助文件上有参数:
-Mlarge_arrays
  -Mnolarge_arrays (default) (linux86-64 only). Allow (don't allow) arrays larger than 2GB;
  -Mlarge_arrays is default with -mcmodel=medium.

想到使用ifort时,如果不使用-heap-arrays,就会在计算大体系时容易内存溢出然后停止计算,于是也就在PGI的编译上使用了-Mlarge_arrays,结果,计算哪怕是个非常简单的结构时,也会在reading WAVECAR后出现错误:
internal ERROR: SETYLM, insufficient INDMAX workspace
比较郁闷和搞笑的是,这个错误在VASP的官方论坛里看,是使用ifort编译的,并且解决方案恰恰就是添加-heap-arrays……
于是实在想不出解决方法来了,来看看大家有什么解决方案没……
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

思想重于技巧,内涵重于表象
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 绿遍山原 at 2012-04-04 17:55:12:
一般不会有哪个程序一次allocate2GB的数组。heap-array是为了把内存申请从栈上移到堆上。

看了一下manual,以前的理解有点误区~
思想重于技巧,内涵重于表象
6楼2012-04-04 19:39:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

thinkllh

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖交流! 2012-04-03 23:31:59
如此,何不直接用ifort, 还 不 存在 2周 试用 的 问 题.
Thinkwiththeworld.
2楼2012-04-03 22:58:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

★
fzx2008: 金币+1, 赞! 2012-04-03 23:32:14
引用回帖:
2楼: Originally posted by thinkllh at 2012-04-03 22:58:13:
如此,何不直接用ifort, 还 不 存在 2周 试用 的 问 题.

考虑到在很多大型机上使用的是PGI或者Pathscale,为了防止今后万一有机会碰上时太抓瞎~
思想重于技巧,内涵重于表象
3楼2012-04-03 23:28:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

★
贺仪: 金币+1, 谢谢参与讨论 2012-04-04 13:26:37
新的一个测试结果,计算一个64个原子的四方对称模型,单核运行没有使用-Mlarge_arrays编译的VASP,居然占用内存6GB,并且没有出错。等待了半个小时,出现了第一个SCF步~不继续等了~先发一个运行中的资源截图。是否这意味着使用PGI的话无需考虑传说中的2GB数组限制问题呢?
思想重于技巧,内涵重于表象
4楼2012-04-04 00:02:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意! +4 zju2000 2026-09-26 4/200 2026-09-27 23:10 by 大飞鱼鱼鱼
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 20:58 by Equinoxhua
[基金申请] 师弟论文见刊大半年才想起来申请专利,还能抢救一下吗? +5 13108017953 2026-09-21 5/250 2026-09-27 16:46 by Leogzhya
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:42 by 4IW0sJvtEqX8
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:26 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:03 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 oeyPlfmMUpOC 2026-09-26 3/150 2026-09-27 09:13 by 4IW0sJvtEqX8
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:44 by XgCC8uTcwILl
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:42 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:39 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:08 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:05 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:53 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 6/300 2026-09-27 05:42 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 5/250 2026-09-25 11:19 by yhq9807
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 7/350 2026-09-25 11:18 by yhq9807
信息提示
请填处理意见