| 查看: 2252 | 回复: 5 | |||
[求助]
vasp并行编译通过，运行却出现错误提示
|
|
vasp并行编译通过，但是在运行的时候出现错误提示是： vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory mpiexec: Warning: tasks 0-7 exited with status 127. 该怎么办，请帮忙，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿中南化学337求调剂
已经有5人回复
-
281求调剂（0805）
已经有23人回复
-
265求调剂
已经有9人回复
-
279分求调剂 一志愿211
已经有10人回复
-
招收调剂硕士
已经有12人回复
-
296求调剂
已经有8人回复
-
招收博士1-2人
已经有3人回复
-
085700资源与环境308求调剂
已经有11人回复
-
274求调剂
已经有8人回复
-
290求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 使用PGI编译VASP中无法使用长数组
已经有5人回复
- 不同功能vasp的编译
已经有4人回复
- vasp并行编译后出现错误，请大家指教
已经有23人回复
- 并行编译vasp出错，make: *** 没有规则可以创建“vasp”需要的目标“xml.o”。 停止
已经有12人回复
- VASP 5.2 集群编译错误 undefined reference to `MAIN__'
已经有8人回复
- vasp5.2 并行编译如何修改makefile
已经有5人回复
- 【求助】vasp编译问题，请自己动手安装成功的人回复！
已经有9人回复
- 【求助】VASP编译出错
已经有5人回复
- 【求助】vasp 编译时候没有错误提示，但是运行时出现“段错误”
已经有14人回复
- 【求助】vasp编译 OFLAG
已经有7人回复
- 【求助】vasp编译时，报错：cannot find -lmkl_em64t
已经有11人回复
2楼2012-07-18 17:52:35
lonewolf659
铜虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 1865.3
- 红花: 1
- 帖子: 145
- 在线: 158.2小时
- 虫号: 482744
- 注册: 2007-12-26
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2012-07-19 23:10:16
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2012-07-19 23:10:16
|
并不是你编译的时候没有指定libguide库。而是你运行vasp时，可执行文件链接不到这个库。这种情况需要修改环境变量，在bash中，输入 export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/(libguide库的路径)/ 不过你的情况不一样，估计你使用的mkl版本较高，已经不提供libguide这个库了。intel网站上有过说明“Since the Intel IPP® 6.0 and Intel® MKL 10.1, the OpenMP libraries ( also called Threading Runtime Libraries) are switching from the legacy OpenMP* run-time library (libguide*) to the compatibility library (libiomp*).”。 按道理说，你在编译的时候就会因为找不到这个库而报错终止了。现在比较可行的办法是重新编译vasp，将libguide库改成libomp*。(具体的名字在mkl里面找找看) |
3楼2012-07-19 11:05:34
|
谢谢回复，后来我在另外一路径，比如/opt/intel/Compiler/11.1/lib/intel64下找到了libguide库，加上路径编辑通过，运行还是同样的问题。 今天把lguide 换成libiomp5，编译，编译通过，运行也是同样的问题。 现在有个问题就是为什么系统里的intel库总是会有好几个。路径不一样，比如我要用的libguide.so、libiomp5.so在/opt/intel/Compiler/11.1/lib/intel64下，而比如说libmkl_intel_lp64,libmkl_intel_core,libmkl_intel_thread 却在/opt/intel/Compiler/11.1/mkl/ib/em64t 下。弄得在编译的时候路径要写很多。按您说的在.bash_profile里加入libguide.so路径，（export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH），结果libmkl_intel_lp64.so就找不到了，再加上libmkl_intel_lp64.so路径，结果libguide.so又找不到。郁闷得不了。 |
4楼2012-07-19 21:38:29
5楼2012-07-20 08:25:20
编译的时候还好，运行vasp的时候就error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such file or directory。请问您是吧libguide.so文件跟哪个库拷到一起？
6楼2015-05-04 09:29:34
