24小时热门版块排行榜    

查看: 2241  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

aylixmut

铜虫 (小有名气)

[求助] vasp并行编译通过,运行却出现错误提示

vasp并行编译通过,但是在运行的时候出现错误提示是:
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
vasp: error while loading shared libraries: libguide.so: cannot open shared object file: No such fie or directory
mpiexec: Warning: tasks 0-7 exited with status 127.

该怎么办,请帮忙,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aylixmut

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lonewolf659 at 2012-07-19 11:05:34
并不是你编译的时候没有指定libguide库。而是你运行vasp时,可执行文件链接不到这个库。这种情况需要修改环境变量,在bash中,输入
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/(libguide库的路径)/
不过你的情况不 ...

谢谢回复,后来我在另外一路径,比如/opt/intel/Compiler/11.1/lib/intel64下找到了libguide库,加上路径编辑通过,运行还是同样的问题。
今天把lguide 换成libiomp5,编译,编译通过,运行也是同样的问题。

现在有个问题就是为什么系统里的intel库总是会有好几个。路径不一样,比如我要用的libguide.so、libiomp5.so在/opt/intel/Compiler/11.1/lib/intel64下,而比如说libmkl_intel_lp64,libmkl_intel_core,libmkl_intel_thread 却在/opt/intel/Compiler/11.1/mkl/ib/em64t 下。弄得在编译的时候路径要写很多。按您说的在.bash_profile里加入libguide.so路径,(export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH),结果libmkl_intel_lp64.so就找不到了,再加上libmkl_intel_lp64.so路径,结果libguide.so又找不到。郁闷得不了。
4楼2012-07-19 21:38:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

aylixmut

铜虫 (小有名气)

个人认为是
BLAS=-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_blacs_intelmpi_ilp64 -lpthread
中未加上 -lguide 参数,
但是我在集群系统未找到libguide.so库,怎么办,有没其他代替的。谢谢!
2楼2012-07-18 17:52:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lonewolf659

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2012-07-19 23:10:16
并不是你编译的时候没有指定libguide库。而是你运行vasp时,可执行文件链接不到这个库。这种情况需要修改环境变量,在bash中,输入
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/(libguide库的路径)/
不过你的情况不一样,估计你使用的mkl版本较高,已经不提供libguide这个库了。intel网站上有过说明“Since the Intel IPP® 6.0 and Intel® MKL 10.1, the OpenMP libraries ( also called Threading Runtime Libraries) are switching from the legacy OpenMP* run-time library (libguide*) to the compatibility library (libiomp*).”。
按道理说,你在编译的时候就会因为找不到这个库而报错终止了。现在比较可行的办法是重新编译vasp,将libguide库改成libomp*。(具体的名字在mkl里面找找看)
差距,差距啊!
3楼2012-07-19 11:05:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aylixmut

铜虫 (小有名气)

成功了,我叫我们管理员把库文件都拷在一起就可以了。
谢谢您,学到了不少的知识。
5楼2012-07-20 08:25:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 4/200 2026-03-16 20:13 by Wangjingyue
[考研] 材料专硕306英一数二 +4 z1z2z3879 2026-03-16 6/300 2026-03-16 19:38 by z1z2z3879
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +3 大火山小火山 2026-03-16 5/250 2026-03-16 16:54 by barlinike
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 285 求调剂 资源与环境 一志愿北京化工大学 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:04 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 工科,求调剂 +3 我887 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 一志愿:武汉理工,材料工程,英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
信息提示
请填处理意见