24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 4485  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci

[求助] vasp分子动力学报错 已有3人参与

最近开始学习做vasp分子动力学,用实验得到的坐标数据和别人提供的INCAR例子稍作修改后进行计算。

报错如下:

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      VASP found    297 degrees of freedom                                   |
|      the temperature will equal 2*E(kin)/ (degrees of freedom)              |
|      this differs from previous releases, where T was 2*E(kin)/(3 NIONS).   |
|      The new definition is more consistent                                  |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           4 )
reading WAVECAR
prediction of wavefunctions initialized - no I/O
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
RMM:   1     0.764392063216E+04    0.76439E+04   -0.67877E+05   744   0.153E+03
RMM:   2     0.162604293910E+04   -0.60179E+04   -0.16132E+05   744   0.684E+02
RMM:   3     0.355026647917E+04    0.19242E+04   -0.99770E+03   744   0.477E+02
RMM:   4    -0.355257110459E+03   -0.39055E+04   -0.34173E+04  2074   0.368E+02
RMM:   5    -0.556354687631E+03   -0.20110E+03   -0.20557E+03  2181   0.685E+01    0.104E+02
RMM:   6    -0.807969295148E+03   -0.25161E+03   -0.40985E+03  1730   0.976E+01    0.105E+02
RMM:   7    -0.518920100251E+03    0.28905E+03   -0.64031E+02  1489   0.525E+01    0.353E+01
RMM:   8    -0.499452185825E+03    0.19468E+02   -0.83667E+01  1584   0.143E+01    0.153E+01
RMM:   9    -0.503489505756E+03   -0.40373E+01   -0.90584E+01  1512   0.131E+01    0.286E+01
RMM:  10    -0.496681907434E+03    0.68076E+01   -0.12014E+01  1574   0.532E+00    0.127E+01
RMM:  11    -0.494480696413E+03    0.22012E+01   -0.59178E+00  1503   0.397E+00    0.362E+00
RMM:  12    -0.494307140858E+03    0.17356E+00   -0.97898E-01  1544   0.131E+00    0.170E+00
RMM:  13    -0.494289008337E+03    0.18133E-01   -0.26473E-01  1628   0.610E-01    0.150E+00
RMM:  14    -0.494254078873E+03    0.34929E-01   -0.10911E-01  1551   0.494E-01    0.679E-01
RMM:  15    -0.494248439290E+03    0.56396E-02   -0.26568E-02  1536   0.246E-01    0.438E-01
RMM:  16    -0.494246774664E+03    0.16646E-02   -0.89946E-03  1457   0.138E-01    0.310E-01
RMM:  17    -0.494245830769E+03    0.94389E-03   -0.40946E-03  1375   0.905E-02    0.165E-01
RMM:  18    -0.494245656830E+03    0.17394E-03   -0.10657E-03  1378   0.426E-02    0.116E-01
RMM:  19    -0.494245540146E+03    0.11668E-03   -0.65529E-04  1240   0.436E-02    0.581E-02
RMM:  20    -0.494245488923E+03    0.51223E-04   -0.12036E-04   865   0.199E-02  
1 T=    NaN E=  NaN           F= -.49424549E+03 E0= -.49424406E+03  EK=  NaN     
   SP= 0.00E+00 SK=  NaN bond charge predicted
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
REAL_OPT: internal ERROR:         -48         -48         -48          32
Job  /jobmgr/lsf8.0/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/intelmpi_wrapper -np 12 /apps/soft/vasp/vasp.5.2/vasp.5.2/vasp
TID   HOST_NAME   COMMAND_LINE            STATUS            TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================00000 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00001 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00002 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00003 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00004 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00005 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00006 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00007 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00008 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00009 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00010 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
00011 c19b15     /apps/soft/vasp/  Done                     11/26/2013 16:48:30
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

夜半酒醒人去后,更持红烛赏残花
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sxjsn1

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wl405103906 at 2014-01-03 15:35:17
楼主你的问题解决了吗?我也出现这种问题,尝试修改参数,都不行。我做的是分子动力学。

没。。。
10楼2014-01-03 20:47:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci

这是INCAR
Zr53 MD
# start parameters
   NWRITE = 2
   ISTART = 0
   ICHARG = 2
   ENCUT = 380


#Electroic  Relaxation
   PREC  = Medium
   NELM =  150
   NELMDL = 5
   EDIFF = 1.0e-4
   LREAL =  auto


#Ionic relaxation
  NSW  =  900
  IBRION  =  0
  ISIF      =   0
  ISYM    =   0
  ISMAR  =  1
  SIGMA  =  0.1
IALGO  =  48
  LDIAG  =  T
  VOSKOWN = 1
  NGX = 78
  NGY = 74
  NGZ = 78


# MD flags
  SMASS  =  2
  POTIM  =  2
  TEBEG  = 400
  TEEND  = 400

#Write flags
  LWAVE =    F
  LCHARG =  F
  LVTOT  =   F
  LELF   =    F
  LORBIT =  F


这是POSCAR部分数据
Cu64Zr36
   1.00000000000000
    12.0000000000000000    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000   11.8000000000000007    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   12.5000000000000000
   Cu   Zr
  64  36
Direct
  0.0445316012624346  0.8767680807860145  0.6543323012345823
  0.0612530510210334  0.5975315534439858  0.2762958886825047
  0.0621291046130281  0.8904940274270459  0.4368290639755159
  0.0637359446944004  0.1744694999170520  0.8685319037139934
  0.0812315172936593  0.2980550432761078  0.5168033781711330
  0.1084071158034305  0.6662314568253791  0.5056049433440037
  0.1344183616036290  0.3962247685368325  0.3367521396043429
  0.1471929769311657  0.7068228518304380  0.9628619945375689
  0.1617505579197100  0.2573339277376760  0.1724685513823090
  0.1669119948037405  0.6910890948599757  0.1340729096298503
  0.1932835613752673  0.4156836164572724  0.6676752363990417
  0.2244594204021482  0.8978810500978298  0.1344598214099051
  0.2250764654001998  0.2997802501499507  0.9128368076884499
  0.2389981702790394  0.0355756381307657  0.5641253099168893
  0.2508580642317213  0.8239284177063908  0.7989103058139762
夜半酒醒人去后,更持红烛赏残花
2楼2013-11-26 17:29:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sxjsn1

金虫 (小有名气)

veni vedi veci

有哪位大能知道我哪儿错了吗?
我NSW=900,1000,3000;POTIM=3,5;SMASS=0,1,2,3都试过了

原子位置根本就不动
夜半酒醒人去后,更持红烛赏残花
3楼2013-11-26 17:31:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snail594

金虫 (小有名气)

建议先按手册后面的MD部分的参数设置,参数越少,错误也就越少。之后再按照自己需要一步步添加部分参数设置。
Inlearningwetrust
4楼2013-11-26 17:53:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学279求调剂 +3 哈哈哈^_^ 2026-03-31 5/250 2026-03-31 01:07 by 拿破龙
[考研] 083000环境科学与工程调剂,总分281 +4 橙子(胜意) 2026-03-30 4/200 2026-03-31 00:44 by Linzejun
[考研] 279求调剂 +12 j的立方 2026-03-29 12/600 2026-03-30 20:30 by dick_runner
[考研] 生物学 296 求调剂 +5 朵朵- 2026-03-26 7/350 2026-03-30 20:07 by 源_2020
[考研] 359求调剂 +5 王了个楠 2026-03-25 5/250 2026-03-30 19:36 by 源_2020
[考研] 一志愿郑州大学,080500学硕,总分317分求调剂 +10 举个栗子oi 2026-03-24 11/550 2026-03-30 19:31 by michael2011
[考研] 310求调剂 +10 争取九点睡 2026-03-30 10/500 2026-03-30 16:45 by ztnimte
[考研] 332求调剂 +6 Lyy930824@ 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:53 by 1172367218
[考研] 337求调剂 +6 《树》 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:15 by herarysara
[考研] 085404求调剂,总分309,本科经历较为丰富 +6 来财aa 2026-03-25 6/300 2026-03-30 09:48 by 青海小西牛
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-24 6/300 2026-03-29 20:45 by 无际的草原
[考研] 329求调剂 +10 钮恩雪 2026-03-25 10/500 2026-03-29 13:32 by peike
[考研] 352分-085602-一志愿985 +5 海纳百川Ly 2026-03-29 5/250 2026-03-29 09:57 by Sjndkwm
[考研] 321求调剂 +7 璞玉~~ 2026-03-25 8/400 2026-03-29 06:41 by 544594351
[考研] 数一英一271专硕(085401)求调剂,可跨 +7 前行必有光 2026-03-28 8/400 2026-03-28 23:22 by 小木虫tim
[考研] 283求调剂 +7 A child 2026-03-28 7/350 2026-03-28 12:05 by zllcz
[考研] 考研调剂 +10 呼呼?~+123456 2026-03-24 10/500 2026-03-27 11:46 by wangjy2002
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 考研一志愿苏州大学初始315(英一)求调剂 +3 sbdksD 2026-03-24 4/200 2026-03-25 18:16 by xcjcqu
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
信息提示
请填处理意见