24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1023  |  回复: 4

David勇

木虫 (小有名气)

[求助] RACE出来的序列怎么确定是自己要的目的mRNA上的序列?

我让公司做5‘RACE,现在结果已经出来了,而且有几十个碱基是我提供的mRNA5’端的序列,这样是不是就可以确定是正确结果了。我在pubmed上BLAST及在UCSC上BLAT却不能比对出测出来的序列和自己提供的核心序列在同一条染色体上。我想问下这样比对应该能出来结果吗?还是因为原来的5‘端还是一个未知序列,所以不能比对出来。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

RACE

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiani_tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-11-13 12:40:04
David勇: 金币+5, 有帮助, 谢谢 2013-11-16 22:06:54
RACE是从已知的EST序列上延伸得到的未知片段,如果和你已知的序列有连续40个核苷酸一致,或者相似度在95%以上,可以认为是得到了该EST的未知序列。
2楼2013-11-13 10:56:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

David勇

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tiani_tan at 2013-11-13 10:56:13
RACE是从已知的EST序列上延伸得到的未知片段,如果和你已知的序列有连续40个核苷酸一致,或者相似度在95%以上,可以认为是得到了该EST的未知序列。

那么将组合之后的序列放在pubmed上Blast比对,以及在UCSC的BLAT却不能找到,这是正常的吗?
3楼2013-11-13 22:19:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)

本帖仅楼主可见
4楼2013-11-28 16:23:51
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

David勇

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 20101296 at 2013-11-28 16:23:51
正常的啊 必须是同一物种统一基因才到达到最大程度的匹配 如果就在数据库里面匹配 如果没有这个序列存储 这也是属于正常的现象

谢谢
5楼2013-11-28 19:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 David勇 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k37jurhrau 2026-05-16 3/150 2026-05-17 01:37 by ue3ir18jc3
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 k37jurhrau 2026-05-16 4/200 2026-05-17 01:35 by ue3ir18jc3
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:57 by ue3ir18jc3
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 3/150 2026-05-17 00:55 by ue3ir18jc3
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:50 by ue3ir18jc3
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 3/150 2026-05-17 00:45 by ue3ir18jc3
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:10 by ue3ir18jc3
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 l7k6xnh0yc 2026-05-14 6/300 2026-05-16 22:55 by ue3ir18jc3
[考博] 现在不知道怎么办,感觉很痛苦 +5 qweww 2026-05-11 6/300 2026-05-16 19:57 by Equinoxhua
[高分子] 本人最近太闲了,谁有问题可以提,每天会统一回复 +9 一切都是空工 2026-05-12 20/1000 2026-05-16 19:52 by Equinoxhua
[有机交流] 求助2,4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 6/300 2026-05-16 19:46 by Equinoxhua
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 3/150 2026-05-16 18:35 by j6b2pdz07o
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人(2026.09) +3 sandyworld 2026-05-15 3/150 2026-05-16 17:11 by zznnnj
[有机交流] 求有机合成大神指点三硫酸乙烯酯(CAS:2793408-99-6)的合成路线 30+3 Leekmid 2026-05-13 10/500 2026-05-16 16:37 by czyzsu
[有机交流] 如何实现卤原子转化 10+3 BT20230424 2026-05-15 5/250 2026-05-16 16:20 by czyzsu
[考博] 2026博士还有哪些学校有名额 +5 小王求读研 2026-05-15 6/300 2026-05-16 10:44 by a4742549
[基金申请] 这年头没有找到涵评专家,还有中面上的可能吗 +11 dd921ww 2026-05-12 13/650 2026-05-16 09:16 by Howard28
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +5 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 5/250 2026-05-16 00:17 by caiyun
[考博] 西南大学考核制博士 +4 lijunjie84 2026-05-11 7/350 2026-05-15 23:20 by 同仁堂教主
[论文投稿] 求助大佬sci投稿哪个好中 +3 江沅188 2026-05-12 4/200 2026-05-13 14:35 by 江沅188
信息提示
请填处理意见