24小时热门版块排行榜    

查看: 981  |  回复: 4

David勇

木虫 (小有名气)

[求助] RACE出来的序列怎么确定是自己要的目的mRNA上的序列?

我让公司做5‘RACE,现在结果已经出来了,而且有几十个碱基是我提供的mRNA5’端的序列,这样是不是就可以确定是正确结果了。我在pubmed上BLAST及在UCSC上BLAT却不能比对出测出来的序列和自己提供的核心序列在同一条染色体上。我想问下这样比对应该能出来结果吗?还是因为原来的5‘端还是一个未知序列,所以不能比对出来。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

RACE

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiani_tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-11-13 12:40:04
David勇: 金币+5, 有帮助, 谢谢 2013-11-16 22:06:54
RACE是从已知的EST序列上延伸得到的未知片段,如果和你已知的序列有连续40个核苷酸一致,或者相似度在95%以上,可以认为是得到了该EST的未知序列。
2楼2013-11-13 10:56:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

David勇

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tiani_tan at 2013-11-13 10:56:13
RACE是从已知的EST序列上延伸得到的未知片段,如果和你已知的序列有连续40个核苷酸一致,或者相似度在95%以上,可以认为是得到了该EST的未知序列。

那么将组合之后的序列放在pubmed上Blast比对,以及在UCSC的BLAT却不能找到,这是正常的吗?
3楼2013-11-13 22:19:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)

本帖仅楼主可见
4楼2013-11-28 16:23:51
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

David勇

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 20101296 at 2013-11-28 16:23:51
正常的啊 必须是同一物种统一基因才到达到最大程度的匹配 如果就在数据库里面匹配 如果没有这个序列存储 这也是属于正常的现象

谢谢
5楼2013-11-28 19:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 David勇 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂310 +3 温柔的晚安 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:16 by peike
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 材料调剂 5+3 想要一壶桃花水 2026-03-25 6/300 2026-03-25 18:20 by xcjcqu
[考研] 材料277求调剂 +4 min3 2026-03-24 4/200 2026-03-25 15:29 by fch1983
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
[考研] 材料学硕,求调剂 6+4 糖葫芦888ll 2026-03-22 9/450 2026-03-25 11:19 by greychen00
[考研] 287求调剂 +10 晨昏线与星海 2026-03-19 11/550 2026-03-25 10:35 by userper
[考研] 289材料与化工(085600)B区求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:20 by mx.yue
[考研] 340求调剂 +5 话梅糖111 2026-03-24 5/250 2026-03-25 06:53 by ilovexiaobin
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +9 材料学257求调剂 2026-03-23 10/500 2026-03-24 07:36 by wangy0907
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 0805材料320求调剂 +3 深海物语 2026-03-20 3/150 2026-03-21 15:46 by 无际的草原
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
信息提示
请填处理意见