| 查看: 2629 | 回复: 4 | ||
[求助]
AutoDock、Vina使用中的一些问题 已有1人参与
|
|
1.在AutoDock中那通过“Docking——>Search Parameters…——>"选择一种算法之后，弹出来一个对话框（已附图）。分别有一个"Runs"和"Cycle"的输入框，这两个各自代表什么？。想要对接100次需要怎么设置？主要是想对结合能进行分析 2.另外我在用Vina的时候，有一个“log.txt”的文件，里面的这些英文分别代表什么啊。 mode | affinity | dist from best mode | (kcal/mol) | rmsd l.b.| rmsd u.b. -----+------------+----------+---------- 1 -6.5 0.000 0.000 2 -6.2 28.079 30.789 3 -5.9 29.035 31.313 4 -5.8 26.887 30.246 5 -5.7 26.230 28.168 6 -5.6 27.449 30.266 7 -5.5 1.262 2.125 8 -5.4 26.819 28.874 9 -5.4 1.938 11.644 Writing output ... done.  6(G$KKY1O[IK1AB5~_}$R@8.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有3人回复
-
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有5人回复
-
求助院士们，这个如何合成呀
已经有4人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
-
想换工作。大多数高校都是 评职称时 认可5年内在原单位取得的成果吗？
已经有7人回复
-
需要合成515-64-0，50g，能接单的留言
已经有4人回复
-
自荐读博
已经有4人回复
-
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
-
带资进组求博导收留
已经有10人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有11人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教关于AUTODOCK做虚i拟筛选的问题
已经有7人回复
- Autodock 中能量的问题
已经有6人回复
- 关于TarFisDock 的问题
已经有3人回复
- FlexX 和 Autodock的优缺点比较
已经有7人回复
- Autodock中受体的准备
已经有14人回复
- 用分子动力学模拟退火进行分子对接
已经有13人回复
- 用Autodock做药物与BSA的对接，有点问题请教
已经有8人回复
- 【软件】最新Win版的Autodock/Vina plugin for PyMOL ！！
已经有132人回复
- tecplot设置镜像后有点问题，各位请进来说话
已经有8人回复
- autodock vina操作视频，以及视频中更新问题
已经有95人回复
- AUTODUCK能不能做四聚体？
已经有8人回复
- 【交流】能否有小木虫版的linux？
已经有16人回复
- 【求助】autodock vina 输入命令报无法读取
已经有8人回复
- 【求助】能够计算结合自由能的分子对接软件除了autodock还有哪些？
已经有7人回复
- 【资源】PyRx-基于autodock的虚拟筛选软件
已经有31人回复
2楼2013-11-09 10:35:11
3楼2013-11-11 13:09:07
|
ok [ 发自小木虫客户端 ] |
4楼2014-01-23 23:17:51
5楼2014-02-07 17:58:19