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AutoDock、Vina使用中的一些问题 已有1人参与
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1.在AutoDock中那通过“Docking——>Search Parameters…——>"选择一种算法之后，弹出来一个对话框（已附图）。分别有一个"Runs"和"Cycle"的输入框，这两个各自代表什么？。想要对接100次需要怎么设置？主要是想对结合能进行分析 2.另外我在用Vina的时候，有一个“log.txt”的文件，里面的这些英文分别代表什么啊。 mode | affinity | dist from best mode | (kcal/mol) | rmsd l.b.| rmsd u.b. -----+------------+----------+---------- 1 -6.5 0.000 0.000 2 -6.2 28.079 30.789 3 -5.9 29.035 31.313 4 -5.8 26.887 30.246 5 -5.7 26.230 28.168 6 -5.6 27.449 30.266 7 -5.5 1.262 2.125 8 -5.4 26.819 28.874 9 -5.4 1.938 11.644 Writing output ... done.  6(G$KKY1O[IK1AB5~_}$R@8.jpg |
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2楼2013-11-09 10:35:11