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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何检测引物之间是否存在二聚体？
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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 如何检测引物之间是否存在二聚体？

做的实验是多重PCR，设计多对引物，如何用primer5.0验证引物之间是否会形成二聚体，还有有哪些方法？非常感谢，望应助~
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1楼 2013-10-19 12:01:29
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永远一片天

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-10-19 14:55:29
直接用红外傅里叶变换光谱检测一下引物RNA样品是否有碱基配对的氢键的特征性红外光谱是否存在即可。

您好，非常感谢您的回复。多对引物，用primer5.0如何验证在同一反应体系的实用性呢？
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3楼2013-10-19 15:41:07
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
直接用红外傅里叶变换光谱检测一下引物RNA样品是否有碱基配对的氢键的特征性红外光谱是否存在即可。
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2楼2013-10-19 14:55:29
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
amisking: 金币+3, 感谢发帖应助，帮助虫子 2013-10-19 19:18:05
永远一片天: 金币+5 2013-10-26 12:24:33
你可以在Primer Premier软件的 Pimer--->Search Criteria---->选Manual（在“Search Mode”框），同时点击“Search Parameters"进入人工搜索参数设置窗口，其中有“Dimer/Hairpin”，可以将“Search Stringency”设置为：very high或者 Moderate。该程序会对引物进行相关参数的搜索和筛选。
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4楼2013-10-19 16:05:13
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