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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 如何检测引物之间是否存在二聚体?

做的实验是多重PCR,设计多对引物,如何用primer5.0验证引物之间是否会形成二聚体,还有有哪些方法?非常感谢,望应助~
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
直接用红外傅里叶变换光谱检测一下引物RNA样品是否有碱基配对的氢键的特征性红外光谱是否存在即可。
2楼2013-10-19 14:55:29
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永远一片天

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-10-19 14:55:29
直接用红外傅里叶变换光谱检测一下引物RNA样品是否有碱基配对的氢键的特征性红外光谱是否存在即可。

您好,非常感谢您的回复。多对引物,用primer5.0如何验证在同一反应体系的实用性呢?
3楼2013-10-19 15:41:07
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
amisking: 金币+3, 感谢发帖应助,帮助虫子 2013-10-19 19:18:05
永远一片天: 金币+5 2013-10-26 12:24:33
你可以在Primer Premier软件的 Pimer--->Search Criteria---->选Manual(在“Search Mode”框),同时点击“Search Parameters"进入人工搜索参数设置窗口,其中有“Dimer/Hairpin”,可以将“Search Stringency”设置为:very high或者 Moderate。该程序会对引物进行相关参数的搜索和筛选。
4楼2013-10-19 16:05:13
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