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pymol 小分子的叠合
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请教大家，我对接了2个化合物进入2个PDB文件（靶点是一样的，也就是说同一靶点的2类小分子，当然PDB不同），想用pymol进行叠合（4个文件，即site和ligand各一对），2个site可以通过A--align--to molecule ……来实现，但是小分子ligand 通过此方法不行，请教如何让也实现小分子的叠合（site叠合site，ligand叠合ligand）,谢谢！ 不知道我有没有说明白，谢谢！  |
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我也遇到这种问题了，一个蛋白晶体结构没有配体，一个晶体结构有配体，让这两个晶体结构叠合比较容易。但是，我自己设计了一个小分子，想要和已经有晶体结构中的小分子进行叠合该怎么处理呢？ 发自小木虫Android客户端 |
10楼2019-11-30 10:22:14
