24小时热门版块排行榜    

查看: 1573  |  回复: 11

w418704194

铜虫 (小有名气)

[求助] sybyl对接结果如何与晶体结果叠合?

sybyl分子对接的结构如何再与晶体叠合回去
叠合的那个值怎么计算呀
没有人带的孩子好可怜 完全入不了门呀
分少 还希望大神见谅 说详细点 谢谢了
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happyqilu

新虫 (初入文坛)


能否保存出pdb构象,然后用chirema或者pymol打开呢
2楼2013-03-19 09:40:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w418704194

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by happyqilu at 2013-03-19 09:40:36
能否保存出pdb构象,然后用chirema或者pymol打开呢

不知道这么做有什么用处呢
3楼2013-03-19 16:26:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-03-21 14:39:39
你是要对比原来受体上的配体吧?sybyl对接的时候本来有那个选项,可以把原来的结构文件加进去做reference structure,后期处理,也可以用RMSD分析。
4楼2013-03-20 15:43:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w418704194

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by arthurii at 2013-03-20 15:43:16
你是要对比原来受体上的配体吧?sybyl对接的时候本来有那个选项,可以把原来的结构文件加进去做reference structure,后期处理,也可以用RMSD分析。

恩 对 我做过 原来的结构文件是不是 那个所谓lianged分子哟 我试过 但是好像没法将它和对接的分子同时显示出来??rsmd在sybyl-x有吗
5楼2013-03-21 09:53:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-21 16:29:23
有的,你把那个ligand保存一下,然后对接完之后再打开就可以了,sybyl-x上面有的
6楼2013-03-21 13:44:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by arthurii at 2013-03-21 13:44:03
有的,你把那个ligand保存一下,然后对接完之后再打开就可以了,sybyl-x上面有的

楼上用的哪一版本的,貌似RMSD没法弄出来
7楼2013-03-22 11:09:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w418704194

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-03-22 11:09:51
楼上用的哪一版本的,貌似RMSD没法弄出来...

难道你可以做叠合哦
8楼2013-03-22 14:51:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by w418704194 at 2013-03-22 14:51:20
难道你可以做叠合哦...

反正什么都做一些
9楼2013-03-22 19:20:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w418704194

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-03-22 19:20:54
反正什么都做一些...

好想你保存结果的时候 有个RSMD
10楼2013-03-23 17:50:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 w418704194 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-21 3/150 2026-03-22 16:54 by i_cooler
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 17/850 2026-03-22 15:18 by 脱颖而出
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 一志愿华中科技大学071000,求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 333求调剂 +5 87639 2026-03-21 7/350 2026-03-21 19:31 by ColorlessPI
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
信息提示
请填处理意见