| 查看: 4798 | 回复: 15 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
pymol 小分子的叠合
|
|||
|
请教大家，我对接了2个化合物进入2个PDB文件（靶点是一样的，也就是说同一靶点的2类小分子，当然PDB不同），想用pymol进行叠合（4个文件，即site和ligand各一对），2个site可以通过A--align--to molecule ……来实现，但是小分子ligand 通过此方法不行，请教如何让也实现小分子的叠合（site叠合site，ligand叠合ligand）,谢谢！ 不知道我有没有说明白，谢谢！  |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有8人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
青基如何破局
已经有7人回复
-
基金不中，共勉
已经有10人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有11人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有6人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有6人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有5人回复
-
梦想
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请帮我用pymol做一个很简单的分子叠合吧，菜鸟我做了很久都叠不上
已经有13人回复
- 请教如何将下载下来的蛋白中的小分子配体删掉？
已经有13人回复
- 关于用Pymol做分子叠合
已经有6人回复
- sybyl对接结果如何与晶体结果叠合？
已经有11人回复
- Pymol分析对接后的pdb文件
已经有6人回复
- 这个蛋白结构图用什么软件可以做出来
已经有5人回复
- 求助高手怎么用pymol做这两个图
已经有6人回复
- ＰＹＭＯＬ软件安装不了
已经有6人回复
- PYMOL与VMD作图的区别
已经有11人回复
- DS 做分子对接
已经有3人回复
- 请教高人，我的pymol软件导入蛋白后进行cartoon时，出现的怎么是loop结构？
已经有13人回复
- 使用Pymol进行蛋白质分子结构的比较
已经有13人回复
- 求教：关于Pymol打开蛋白质结构文件的问题
已经有3人回复
- 请高手指导，我的pymol为何不显示氢键
已经有4人回复
- 用pymol显示氢键的问题，在线等，急需解决，谢谢！
已经有4人回复
- Pymol中批量叠合脚本
已经有3人回复
- pymol作图，谢谢
已经有6人回复
sunshine???
新虫 (职业作家)
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 12062
- 散金: 1241
- 红花: 13
- 帖子: 3317
- 在线: 177小时
- 虫号: 4566282
- 注册: 2016-04-03
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
|
我也遇到这种问题了，一个蛋白晶体结构没有配体，一个晶体结构有配体，让这两个晶体结构叠合比较容易。但是，我自己设计了一个小分子，想要和已经有晶体结构中的小分子进行叠合该怎么处理呢？ 发自小木虫Android客户端 |
10楼2019-11-30 10:22:14
2楼2013-10-09 18:26:01
alarace
至尊木虫 (知名作家)
- 应助: 82 (初中生)
- 金币: 21154.3
- 散金: 15172
- 红花: 20
- 帖子: 9322
- 在线: 2799.7小时
- 虫号: 1546961
- 注册: 2011-12-22
- 专业: 微生物生理与生物化学
3楼2013-10-09 20:47:33
4楼2013-10-10 10:11:00
投票: