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lunalovehj木虫 (小有名气)
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用16s rDNA与16s rRNA的测序做土壤微生物多样性有什么区别？
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最近读了好多关于土壤微生物多样性研究的文章，大多都是要用16s rRNA测序来做的，大多都是谱了一张以“门”为分类阶元的图，表示微生物的组成。 但是有个测序公司的人想跟我们签订16s rDNA测序的合同，宣传说也可以研究土壤群落结构多样性，那么这两者测出来有什么差别呢？ 我们实验室才开始接触分子试验，所以有好多理论都不懂，请各位不吝赐教呀~~ |
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lunalovehj
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16S rDNA测的是所有细菌的（包括活菌和死菌）；16S rRNA测的是现存的活的细菌。 解释：DNA是比较稳定的，有些细菌死亡后，DNA仍存在于土壤之中。而RNA不稳定，很容易被分解，你提到的RNA就说明是现存的活菌的，因此RNA更能说明土壤微生物的多样性。不过，貌似从土壤中去提RNA真的不太好提。。 |
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