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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS分子对接怎么评价？
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天湖酒

新虫 (初入文坛)

[求助] DS分子对接怎么评价？

用DS做分子对接后出现了好几个pose，要怎么选择哪一个pose好呢
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1楼2013-09-11 15:00:40
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
天湖酒: 金币+2, ★有帮助 2013-10-15 08:05:58
主要看-CDocker Energy 以及 -CDocker Interaction Energy值越高越好
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宅若久时天然呆，呆到深处自然萌
2楼2013-10-14 10:21:06
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thanking1669

木虫 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by monsoncupid at 2013-10-14 10:21:06
主要看-CDocker Energy 以及 -CDocker Interaction Energy值越高越好

如果只取一个最好的pose，-CDocker Energy 和 -CDocker Interaction Energy看那个呢
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3楼2013-10-22 22:15:25
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

一般而言是看前者的，因为前者是总能量，后者是相互作用能，如果还想再做的精细一点的话可以对打分程序本身做一个评级，就是以天然底物为reference，根据对接后配体RMSD值来评价打分函数- -！~希望对你有帮助
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宅若久时天然呆，呆到深处自然萌
4楼2013-10-23 15:51:36
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