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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 关于HSA的pdb文件！
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dinghuachen

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 关于HSA的pdb文件！

我从RCSB下载了HSA的pdb文件，发现其中有两条链（chain A,B），它们的序列似乎一样，只是坐标不一样。请问我到底应该选择哪一条链呀作为HSA的初始结构，还有不知这两链之间有什么内在的关系吗？
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Where-amazing-happens.
1楼 2013-09-05 15:25:58
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

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★ ★ ★ ★ ★
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dinghuachen: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢！ 2013-09-05 21:39:32
删除其中一条链，HSA活性中心不是两个亚基共同形成！两个亚基有相同的活性中心
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2楼2013-09-05 19:52:21
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dinghuachen

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2013-09-05 19:52:21
删除其中一条链，HSA活性中心不是两个亚基共同形成！两个亚基有相同的活性中心

不知是什么原因导致pdb文件里面有两个HSA呀，在这种情况下，不是一个链就可以了吗？还有，pdb文件中似乎HSA的最前面和最后面少了一些氨基酸残基中原子的具体坐标信息，有什么方法补全吗？
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Where-amazing-happens.
3楼2013-09-05 21:46:10
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dinghuachen: 金币+3, ★★★很有帮助, 明白了，多谢！ 2013-09-06 14:36:05
很多蛋白结晶的时候是二聚体结晶
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4楼2013-09-06 13:36:32
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