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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 请教试剂盒提DNA纯度问题
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0215上善若水

金虫 (正式写手)

[求助] 请教试剂盒提DNA纯度问题

请教试剂盒提DNA纯度问题

我用试剂盒提完DNA，测了纯度方面：
    浓度                               260/280                              260/230
88.9                                      1.93                                      0.29
101.0                                    1.89                                       0.3
58.7                                      1.94                                       0.24
感觉260/280比1.8偏高些，而260/230远远偏低（小于2），不知道是什么原因造成的，忘各位大侠帮忙给分析下
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1楼 2013-07-08 20:44:36
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0215上善若水

金虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-14 03:33:11
我觉得不值，就没有用...

哦，这样子啊，那就是直接测序了吧
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13楼2013-07-14 07:29:09
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hhxq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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0215上善若水: 金币+3 2013-07-09 08:24:06
土壤DNA吗？腐殖酸会干扰的，提出来以后是什么颜色的？wash buffer 至少得洗两遍。之前的抑制剂去除的那步也不能省略。
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2楼2013-07-08 21:16:00
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0215上善若水

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hhxq at 2013-07-08 21:16:00
土壤DNA吗？腐殖酸会干扰的，提出来以后是什么颜色的？wash buffer 至少得洗两遍。之前的抑制剂去除的那步也不能省略。

是土壤DNA，提出来是无色的。这个是用试剂盒提的，中间有些步骤不能重复哦。
你们一般用的什么方法呢？
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3楼2013-07-09 08:23:59
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DoRbIr

金虫 (正式写手)
我也是类似你这样啊，有的260/230都快接近零了，问了OMEGA的技术支持，他们也说不出什么来，不过PCR什么的都没有影响，有人推荐我用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化。
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4楼2013-07-09 08:57:37
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0215上善若水

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-09 08:57:37
我也是类似你这样啊，有的260/230都快接近零了，问了OMEGA的技术支持，他们也说不出什么来，不过PCR什么的都没有影响，有人推荐我用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化。

哦，那用这个扩出来的产物直接测序应该没有什么影响吧。
唉，就是不知道是什么原因，OD260/230居然这么低
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5楼2013-07-09 09:18:28
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DoRbIr

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 0215上善若水 at 2013-07-09 09:18:28
哦，那用这个扩出来的产物直接测序应该没有什么影响吧。
唉，就是不知道是什么原因，OD260/230居然这么低...

OMEGA的技术支持也不是很清楚，他说我的操作没有问题。你说的直接测序是用高通量是吧？
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6楼2013-07-10 15:30:41
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0215上善若水

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-10 15:30:41
OMEGA的技术支持也不是很清楚，他说我的操作没有问题。你说的直接测序是用高通量是吧？...

嗯，是的，这样子能用不？
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7楼2013-07-13 17:50:21
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0215上善若水

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-09 08:57:37
我也是类似你这样啊，有的260/230都快接近零了，问了OMEGA的技术支持，他们也说不出什么来，不过PCR什么的都没有影响，有人推荐我用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化。

那你用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化后结果怎么样？含量得率是多少？
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8楼2013-07-13 17:51:09
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0215上善若水

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 0215上善若水 at 2013-07-09 09:18:28
哦，那用这个扩出来的产物直接测序应该没有什么影响吧。
唉，就是不知道是什么原因，OD260/230居然这么低...

嗯，就是，我现在很纠结这个啊。你后期怎么解决这个问题了？
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9楼2013-07-13 17:52:07
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DoRbIr

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 0215上善若水 at 2013-07-13 17:51:09
那你用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化后结果怎么样？含量得率是多少？...

我觉得不值，就没有用
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10楼2013-07-14 03:33:11
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