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0215上善若水

金虫 (正式写手)

[求助] 请教试剂盒提DNA纯度问题

请教试剂盒提DNA纯度问题

我用试剂盒提完DNA,测了纯度方面:
    浓度                               260/280                              260/230
88.9                                      1.93                                      0.29
101.0                                    1.89                                       0.3
58.7                                      1.94                                       0.24
感觉260/280比1.8偏高些,而260/230远远偏低(小于2),不知道是什么原因造成的,忘各位大侠帮忙给分析下
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0215上善若水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-14 03:33:11
我觉得不值,就没有用...

哦,这样子啊,那就是直接测序了吧
13楼2013-07-14 07:29:09
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hhxq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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0215上善若水: 金币+3 2013-07-09 08:24:06
土壤DNA吗?腐殖酸会干扰的,提出来以后是什么颜色的?wash buffer 至少得洗两遍。之前的抑制剂去除的那步也不能省略。
2楼2013-07-08 21:16:00
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0215上善若水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hhxq at 2013-07-08 21:16:00
土壤DNA吗?腐殖酸会干扰的,提出来以后是什么颜色的?wash buffer 至少得洗两遍。之前的抑制剂去除的那步也不能省略。

是土壤DNA,提出来是无色的。这个是用试剂盒提的,中间有些步骤不能重复哦。
你们一般用的什么方法呢?
3楼2013-07-09 08:23:59
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DoRbIr

金虫 (正式写手)

我也是类似你这样啊,有的260/230都快接近零了,问了OMEGA的技术支持,他们也说不出什么来,不过PCR什么的都没有影响,有人推荐我用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化。
4楼2013-07-09 08:57:37
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0215上善若水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-09 08:57:37
我也是类似你这样啊,有的260/230都快接近零了,问了OMEGA的技术支持,他们也说不出什么来,不过PCR什么的都没有影响,有人推荐我用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化。

哦,那用这个扩出来的产物直接测序应该没有什么影响吧。
唉,就是不知道是什么原因,OD260/230居然这么低
5楼2013-07-09 09:18:28
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DoRbIr

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 0215上善若水 at 2013-07-09 09:18:28
哦,那用这个扩出来的产物直接测序应该没有什么影响吧。
唉,就是不知道是什么原因,OD260/230居然这么低...

OMEGA的技术支持也不是很清楚,他说我的操作没有问题。你说的直接测序是用高通量是吧?
6楼2013-07-10 15:30:41
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0215上善若水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-10 15:30:41
OMEGA的技术支持也不是很清楚,他说我的操作没有问题。你说的直接测序是用高通量是吧?...

嗯,是的,这样子能用不?
7楼2013-07-13 17:50:21
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0215上善若水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-07-09 08:57:37
我也是类似你这样啊,有的260/230都快接近零了,问了OMEGA的技术支持,他们也说不出什么来,不过PCR什么的都没有影响,有人推荐我用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化。

那你用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化后结果怎么样?含量得率是多少?
8楼2013-07-13 17:51:09
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0215上善若水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 0215上善若水 at 2013-07-09 09:18:28
哦,那用这个扩出来的产物直接测序应该没有什么影响吧。
唉,就是不知道是什么原因,OD260/230居然这么低...

嗯,就是,我现在很纠结这个啊。你后期怎么解决这个问题了?
9楼2013-07-13 17:52:07
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DoRbIr

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 0215上善若水 at 2013-07-13 17:51:09
那你用QIAGEN的DNA Stool Mini Kit纯化后结果怎么样?含量得率是多少?...

我觉得不值,就没有用
10楼2013-07-14 03:33:11
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