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蓝色精灵0502

新虫 (初入文坛)

[求助] clustalx软件处理比对序列

我是新手,正在学习序列处理,想知道用clustalx软件怎么能处理出这样的多序列比对结果啊,谢谢帮忙!
clustalx软件处理比对序列
360桌面截图20130626164639.jpg


clustalx软件处理比对序列-1
360桌面截图20130626164639.jpg
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niil

金虫 (正式写手)

★
蓝色精灵0502(myprayer代发): 金币+1, Gifts of roses, hand there are lingering fragrance. Look forward to your wonderful and more detailed answer. 2013-06-27 08:46:25
把需要比对的序列作成fasta格式,直接输入到clustalX,设定好参数之后进行比对,比对好之后,clustalX 可以直接生成.PS文件(File菜单里的Write Alignment to Postscript),如果你装了professional版的adobe acrobat reader的话,直接双击.PS文件就可以生成PDF文件,PDF文件里就直接是如图比对好的序列。
楼主出示的比对结果貌似在某一个网站上可以处理clustal生成的aln文件,进而生成类似的比对结果。
clustalx软件处理比对序列-2
a.jpg

Stop fighting,let it flow.
2楼2013-06-26 18:07:52
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biology-boy

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
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3楼2013-06-26 19:00:46
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蓝色精灵0502

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by niil at 2013-06-26 18:07:52
把需要比对的序列作成fasta格式,直接输入到clustalX,设定好参数之后进行比对,比对好之后,clustalX 可以直接生成.PS文件(File菜单里的Write Alignment to Postscript),如果你装了professional版的adobe acrob ...

非常感谢,我再试试,可能是我的adobe acrobat reader版本不够,.
PS文件不能直接生成PDF文件。
4楼2013-06-27 08:33:51
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蓝色精灵0502

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by biology-boy at 2013-06-26 19:00:46
DNA比对序列还是用DNAMAN把那个功能比较全,再在网上查找同源相似物种就可以了。

我是从别人那传的clustalX,用着还挺方便,DNAMAN使用简单吗?
5楼2013-06-27 08:36:47
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xiafan

新虫 (初入文坛)

下了不会用
6楼2014-01-15 09:20:10
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蓝的飞

新虫 (初入文坛)

新手,请问clustalx怎么用啊,那个需要的序列怎么做成fasta格式啊,万分感谢
7楼2014-01-16 17:57:51
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