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基因表达问题
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各位虫友好： 我想问一下，我的基因终止密码后面无意的又加入了一个终止密码子，然后后面是完整的3‘UTR序列，这样的话会对表达效率造成影响吗？因为我选用的是自主型表达的启动子。 |
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 核酸生物学实验经验 |
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【答案】应助回帖
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-06-26 12:54:13
gyesang: 回帖置顶 2013-06-26 12:54:23
zhousf0114: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-06-26 15:28:22
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目前对于翻译的终止密码子的文献好像不是很强调多个终止密码子之间会有相互干扰，我没有看到过此类材料，除非更靠近3’末端的终止密码子会参与形成特定的二级结构，并且这样的二级结构足以影响前一个终止密码子的所在区域形成新的二级结构，或者说形成Riboswitch，不过至少在原核细胞中Riboswitch多在5'-UTR，在植物细胞中倒是有在3'-UTR形成Riboswitch的。但是即使形成了Riboswitch，没有小分子的效应物----SAM，TPP等，Riboswitch的构象也不会发生改变而调节翻译起始。Riboswitch对RNA的二级结构的要求还是很高的，只加入一个终止密码子不太可能形成新的Riboswitch。 至于会不会引起translational hopping 和 改变splicing ，着我就不知道了，但是translational hopping 和splicing 也是对于RNA的二级结构有一定的要求，只加入一个终止密码子不太可能形成新的translational hopping 和splicing 。 楼主可以做试验试一下。 |
6楼2013-06-25 20:39:58
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【答案】应助回帖
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目前对于翻译的终止密码子的文献好像不是很强调多个终止密码子之间会有相互干扰，一般就是第一个终止密码子（最为靠近5’末端）能够起到中止翻译的作用。 但是实际上也许不是一定会如此。 如果第一个终止密码子与3’-UTR的间距与一般情况下的平均间距不是差得较多的话。但是如果更加最为靠近5’末端的那个终止密码子对于3’-UTR的有关茎环结构离得很远（超过2个以上的核糖体的最大宽度），而更靠近3’末端的那个终止密码子对于3’-UTR的有关茎环结构离得比较适当（大致在1个核糖体的最大宽度之内），那么核糖体到底选择哪个终止密码子可能就有一定的概率问题，既可能会选择更靠近3’末端的那个终止密码子的密码子，怎可能不是一个热力学问题，而是动力学问题。 |
7楼2013-06-25 20:50:47
8楼2013-06-26 15:28:12
9楼2013-06-26 15:28:40
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