应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 细菌属种鉴定问题
51/1返回列表
查看: 4114  |  回复: 21
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zuihouyizhan

金虫 (小有名气)

[求助] 细菌属种鉴定问题

想请教大家一下，通过16sDNA片段的扩增，测序比对能精确到种吗？之前一直认为是可以的，所以用这种方法鉴定菌株几个月了，可近期发现，序列相似度很高的菌株，菌落形态差好多，不知是我操作问题还是这种鉴定16s鉴定菌种的方法不可靠，求专家指点
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

技术探讨

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-06-18 15:28:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

见神一笑

木虫 (著名写手)
跟你的菌相似度最高的菌株都是以发表的标准菌株吗？如果不是的，就像楼下所说的，可信度不高。而且下面的同仁说得对，要发表必须要克隆测序，才能得到尽可能长的准确的序列。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

zuihouyizhan
好好努力
9楼2013-06-21 10:18:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 22 个回答

qiaolinkun

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖应助！ 2013-06-18 20:55:23
zuihouyizhan: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-06-19 11:13:40
我也遇到相同的问题，两种菌落形态相差很大的菌，blast结果居然是同种！我尝试使用过不同基因序列库进行检索，结果也不相同。询问专家意见是要结合生化反应与血清学鉴定，blast理论上能精确到亚种，但其序列都是开放性的，不一定都是已发表的序列，可信度不是最高。而且实验时有可能存在片段交叉污染，比如DNA的气溶胶也有可能会对PCR产生一定影响的。
赞一下 回复此楼
2楼2013-06-18 20:40:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zuihouyizhan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qiaolinkun at 2013-06-18 20:40:29
我也遇到相同的问题，两种菌落形态相差很大的菌，blast结果居然是同种！我尝试使用过不同基因序列库进行检索，结果也不相同。询问专家意见是要结合生化反应与血清学鉴定，blast理论上能精确到亚种，但其序列都是开放 ...

哦，这样呀，可是每株都做生化反应那工作量太多了，我是做细菌多样性的，这样一下子不知咋办了
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2013-06-19 11:11:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2981249

至尊木虫 (文坛精英)

木有

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zuihouyizhan: 金币+5 2013-06-20 10:41:19
16S太保守,很多时候只有一个它的序列很难定位到种,不能完全区分开同属不同种的细菌,建议楼主再扩一下其他持家基因

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
帅是一种态度
4楼2013-06-19 23:06:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 22 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +3 好运来～9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来～9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭