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taqman荧光定量PCR交流
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lxyconan
新虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
金币: 249.8
帖子: 36
在线: 7.8小时
虫号: 874176
[交流]
taqman荧光定量PCR交流
首先我先说明一下做实验的目的:要区分不同的基因型并且定量。在上海辉睿定的探针。引物不管是大浓度的dna还是小浓度都能跑出来,小浓度的能看到引物二聚体。并且也跑过梯度50到60条带亮度没有差别。小弟初接触荧光定量,经验不足,希望和大师们多交流一下。图片是荧光遇到的问题,最后的是对荧光产物进行电泳。
1、我感觉曲线有点儿趴(扩增曲线不趴,但是原始曲线很趴,没有明显的S型感觉),有的时候57度可以跑出来,但是同时做的54 55的时候曲线上下抖动特别厉害,一直没有弄清楚什么原因,感觉温度越低ct值越小。
2、引物我跑过梯度,临床检测的102 左右浓度的样本, 50℃到60℃都能跑出来,55摄氏度之后的条带偏亮。做探针实验一直用的是>108的样本,但是ct值比临床的要高(差至少一个数量级左右),我怕弱阳性的标本检测不出来,以后做定量也受影响。
3、个人感觉探针的Tm值是不是太低了?导致的结合效率收到影响?是否有必要重新设计探针?或者用MGB探针
4、探针能不能靠近下游引物?
5、探针3端需不需要磷酸化,有时候有以探针为引物扩增出来非特异性条带
6、探针的5端 配对实验影响大不大?
图片1.png
图片2.png
图片3.png
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1楼
2013-05-06 11:25:46
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rggworld
木虫
(职业作家)
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虫号: 1520757
★
lxyconan(金币+1): 谢谢参与
祝楼主诸事顺利,万事如意!
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22楼
2013-05-06 13:54:45
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纯木木鱼
新虫
(初入文坛)
★
lxyconan(金币+1): 谢谢参与
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2楼
2013-05-06 11:42:21
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金虫
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★ ★
lxyconan(金币+1): 谢谢参与
lxyconan(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助!
2013-05-06 12:22:41
感觉你的这对引物探针扩增很差,估计你得换探针了
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4楼
2013-05-06 12:04:17
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纯木木鱼
新虫
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lxyconan(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助!
2013-05-06 12:23:19
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5楼
2013-05-06 12:04:20
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