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smy897579

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助关于初学者研究蛋白质模拟的问题

本人是做基因工程的,想问问各位,如果我通过基因技术合成了一种全新的酶,我可以通过分子模拟的什么技术进行下一步研究,可以发影响因子较高的文章呢,我对分子模拟不是很清楚,希望大家多指点,谢谢。
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smy897579

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by kshuizhuyu at 2013-04-29 09:30:45
先找到你的酶的氨基酸序列,用spdViewer等分子模拟软件构建出蛋白质模型,再优化,找到跟它作用的配体,像底物,辅因子等等,最后用Autodock软件进行分子对接,就可以了解其作用机理了,不过我也是这方面的新手,呵呵 ...

谢谢你的建议哦,感觉挺好的,我会好好学习的,有不会的再找你联系,共同探讨,谢谢你的帮助。
7楼2013-05-01 08:38:34
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shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-04-29 15:09:11
至于做什么研究的话我觉得应该是看你的这个酶能起什么作用吧,能研究的东西其实挺多的,构象变化啊,抑制剂作用啊,反应机理啊什么什么的,很多的
2楼2013-04-28 09:11:24
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smy897579

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shengxiang at 2013-04-28 09:11:24
至于做什么研究的话我觉得应该是看你的这个酶能起什么作用吧,能研究的东西其实挺多的,构象变化啊,抑制剂作用啊,反应机理啊什么什么的,很多的

哦,我可能没说清楚,这个酶是我所研究的代谢途径中的关键酶--醛脱氢酶,请多指点。反应机理的研究应该用什么软件呢,求推荐。
3楼2013-04-28 13:25:28
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by smy897579 at 2013-04-28 13:25:28
哦,我可能没说清楚,这个酶是我所研究的代谢途径中的关键酶--醛脱氢酶,请多指点。反应机理的研究应该用什么软件呢,求推荐。...

做反应机理的话,GAUSSIAN就可以做,用ONIOM方法来做
4楼2013-04-28 13:58:39
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