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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】蛋白质大小
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kisscat

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】蛋白质大小 已有7人参与

对蛋白质不了解，弱弱的问一下，一般蛋白质的大小有多大，因为我想用蛋白质吸附包被纳米材料，材料有2-5纳米大，不知道蛋白质的大小是否够，也就是蛋白质是不是可以比2-5纳米大，问题比较弱智，不好意思。
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1楼 2010-10-11 10:37:58
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by 樱蓝子 at 2015-05-28 14:47:07
多谢...

首先去pdb数据库下载bsa的蛋白结构（download files——pdf file （text），现以4F5S为例），安装pymol软件，使用pymol打开下载的bsa文件。左上角 all-A-preset-pretty，你能获得一个飘带图（图1）。回到pymol的控制界面，wizard-measurement 你会在右下角获得一个对话框。点击distance，而后点击你想测量的两个氨基酸中的原子，就会给出你距离，如图2.
【求助/交流】蛋白质大小
BAS.png


【求助/交流】蛋白质大小-1
BSA2.png
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13楼2015-05-28 23:27:43
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月月大可

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2):鼓励分享经验！ 2010-10-11 19:48:54
偶就是做结构生物学的，绝大多数的蛋白会大于2-3nm。
我们一般使用的单位是埃，也就是十分之一nm，一般的氢键在4埃以内。而蛋白的大小少说也有上百埃。
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樱蓝子
7楼2010-10-11 19:23:28
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普通回帖

yyqqzz

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
silicare:Å，怎么个意思 2010-10-11 11:58:43
silicare:小木虫系统现实不出来，建议大家还是不要用太生僻的符号了 2010-10-11 11:59:43
蛋白小点的有十几个Å，大点的有几百个Å
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2楼2010-10-11 11:24:20
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王会征

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
不同的蛋白质大小差距太大了，小的几个kDa，大的成百上千个kDa啊。
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3楼2010-10-11 14:28:42
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ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2):鼓励交流！ 2010-10-11 19:48:41
那得看蛋白质的形状啊。就算是同一个蛋白，球状的和变性以后棒状的还不一样大呢。

研究的比较透的蛋白，结构解析过的话，都会有相应的空间结构数据的，pdb数据库里找找看。要是只有序列的话，找几个数据库模拟一下结构，也能给出个大概的大小
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4楼2010-10-11 16:20:58
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guobay

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个问题很邪恶啊~不会仅仅是一个构思吧？但我觉得可能性不大啊！蛋白质一般不会留那么的的空隙的，不然就没有生理活性了。可以考虑用病毒啊~。
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5楼2010-10-11 18:03:21
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王会征

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
呵呵，创新性很好啊。
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6楼2010-10-11 18:05:50
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kisscat

铜虫 (小有名气)
谢谢各位的回复，这个想法确实现在只是一个构思
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8楼2010-10-12 10:57:29
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樱蓝子

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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引用回帖:
7楼: Originally posted by 月月大可 at 2010-10-11 19:23:28
偶就是做结构生物学的，绝大多数的蛋白会大于2-3nm。
我们一般使用的单位是埃，也就是十分之一nm，一般的氢键在4埃以内。而蛋白的大小少说也有上百埃。

您好，我是做材料的想测了解BSA和BHb的纳米尺寸，请问你们知道吗，已经在PDB上看了，可是找不到他们的大小，求助
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9楼2015-05-25 16:09:38
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by 樱蓝子 at 2015-05-25 16:09:38
您好，我是做材料的想测了解BSA和BHb的纳米尺寸，请问你们知道吗，已经在PDB上看了，可是找不到他们的大小，求助...

在pymol中打开，里面有测量原子距离的功能
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樱蓝子 樱蓝子
10楼2015-05-25 23:16:09
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