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kisscat

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】蛋白质大小已有7人参与

对蛋白质不了解,弱弱的问一下,一般蛋白质的大小有多大,因为我想用蛋白质吸附包被纳米材料,材料有2-5纳米大,不知道蛋白质的大小是否够,也就是蛋白质是不是可以比2-5纳米大,问题比较弱智,不好意思。
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月月大可

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by 樱蓝子 at 2015-05-28 14:47:07
多谢...

首先去pdb数据库下载bsa的蛋白结构(download files——pdf file (text),现以4F5S为例),安装pymol软件,使用pymol打开下载的bsa文件。左上角 all-A-preset-pretty,你能获得一个飘带图(图1)。回到pymol的控制界面,wizard-measurement 你会在右下角获得一个对话框。点击distance,而后点击你想测量的两个氨基酸中的原子,就会给出你距离,如图2.
【求助/交流】蛋白质大小
BAS.png


【求助/交流】蛋白质大小-1
BSA2.png

13楼2015-05-28 23:27:43
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月月大可

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2):鼓励分享经验! 2010-10-11 19:48:54
偶就是做结构生物学的,绝大多数的蛋白会大于2-3nm。
我们一般使用的单位是埃,也就是十分之一nm,一般的氢键在4埃以内。而蛋白的大小少说也有上百埃。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2010-10-11 19:23:28
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普通回帖

yyqqzz

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare:Å,怎么个意思 2010-10-11 11:58:43
silicare:小木虫系统现实不出来,建议大家还是不要用太生僻的符号了 2010-10-11 11:59:43
蛋白小点的有十几个Å,大点的有几百个Å
2楼2010-10-11 11:24:20
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王会征

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不同的蛋白质大小差距太大了,小的几个kDa,大的成百上千个kDa啊。
3楼2010-10-11 14:28:42
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ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2):鼓励交流! 2010-10-11 19:48:41
那得看蛋白质的形状啊。就算是同一个蛋白,球状的和变性以后棒状的还不一样大呢。

研究的比较透的蛋白,结构解析过的话,都会有相应的空间结构数据的,pdb数据库里找找看。要是只有序列的话,找几个数据库模拟一下结构,也能给出个大概的大小
4楼2010-10-11 16:20:58
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guobay

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个问题很邪恶啊~不会仅仅是一个构思吧?但我觉得可能性不大啊!蛋白质一般不会留那么的的空隙的,不然就没有生理活性了。可以考虑用病毒啊~。
5楼2010-10-11 18:03:21
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王会征

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
呵呵,创新性很好啊。
6楼2010-10-11 18:05:50
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kisscat

铜虫 (小有名气)

谢谢各位的回复,这个想法确实现在只是一个构思
8楼2010-10-12 10:57:29
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樱蓝子

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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引用回帖:
7楼: Originally posted by 月月大可 at 2010-10-11 19:23:28
偶就是做结构生物学的,绝大多数的蛋白会大于2-3nm。
我们一般使用的单位是埃,也就是十分之一nm,一般的氢键在4埃以内。而蛋白的大小少说也有上百埃。

您好,我是做材料的想测了解BSA和BHb的纳米尺寸,请问你们知道吗,已经在PDB上看了,可是找不到他们的大小,求助
9楼2015-05-25 16:09:38
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月月大可

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by 樱蓝子 at 2015-05-25 16:09:38
您好,我是做材料的想测了解BSA和BHb的纳米尺寸,请问你们知道吗,已经在PDB上看了,可是找不到他们的大小,求助...

在pymol中打开,里面有测量原子距离的功能

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

10楼2015-05-25 23:16:09
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