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【求助/交流】蛋白质大小
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kisscat
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[交流]
【求助/交流】蛋白质大小
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对蛋白质不了解,弱弱的问一下,一般蛋白质的大小有多大,因为我想用蛋白质吸附包被纳米材料,材料有2-5纳米大,不知道蛋白质的大小是否够,也就是蛋白质是不是可以比2-5纳米大,问题比较弱智,不好意思。
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2010-10-11 10:37:58
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引用回帖:
12楼
:
Originally posted by
樱蓝子
at 2015-05-28 14:47:07
多谢...
首先去pdb数据库下载bsa的蛋白结构(download files——pdf file (text),现以4F5S为例),安装pymol软件,使用pymol打开下载的bsa文件。左上角 all-A-preset-pretty,你能获得一个飘带图(图1)。回到pymol的控制界面,wizard-measurement 你会在右下角获得一个对话框。点击distance,而后点击你想测量的两个氨基酸中的原子,就会给出你距离,如图2.
BAS.png
BSA2.png
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13楼
2015-05-28 23:27:43
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小木虫(金币
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silicare:Å,怎么个意思 2010-10-11 11:58:43
silicare:小木虫系统现实不出来,建议大家还是不要用太生僻的符号了 2010-10-11 11:59:43
蛋白小点的有十几个Å,大点的有几百个Å
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2010-10-11 11:24:20
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
不同的蛋白质大小差距太大了,小的几个kDa,大的成百上千个kDa啊。
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2010-10-11 14:28:42
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专业: 微生物生理与生物化学
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amisking(金币+2):鼓励交流! 2010-10-11 19:48:41
那得看蛋白质的形状啊。就算是同一个蛋白,球状的和变性以后棒状的还不一样大呢。
研究的比较透的蛋白,结构解析过的话,都会有相应的空间结构数据的,pdb数据库里找找看。要是只有序列的话,找几个数据库模拟一下结构,也能给出个大概的大小
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4楼
2010-10-11 16:20:58
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