| 查看: 2455 | 回复: 18 | |||
[交流]
求助细菌基因组组装
|
|||
| 咨询一下做这方面的高手。我现在从原始的数据中(宏基因组测序)中找到了属于一个细菌的contigs,然后跟另一个已发表的同种细菌的全基因组做比对,发现了大概几百个的gaps。现在的问题就是我怎么去快速的去填补这些gaps,把contigs拼接好?有没有这方面的辅助软件可以用?显然手工去定位这些gaps好慢。有用的答案定重谢! |
» 猜你喜欢
富马酸贝达喹啉:二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
BT投稿with editor状态快两周了,正常吗
已经有25人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有271人回复
Silevertinib(BDTX-1535)结构拆解:炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
RO4929097 解析:双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出:SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复
logP 6.1 的羧酸怎么配母液:GSK 650394 的溶解窗口与稀释顺序
已经有0人回复
从"水不溶"到 71 mg/mL:雷特格韦的 pH 依赖溶解与螯合色谱边界
已经有0人回复
133 Ų 的极性表面积,如何决定 TNG462 的母液配制与色谱条件
已经有0人回复
两个氟原子与一段氨基甲酸甲酯:BLU-5937 的母液配制与稳定性边界
已经有0人回复
司美那非(TPN171):从嘧啶酮母核到工艺放大的结构、色谱与质控参数解析
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
大家都是用什么方法提细菌基因组呢(文库用)
已经有26人回复
用试剂盒提细菌基因组 有个菌提不出来~~求解
已经有5人回复
细菌基因组文库构建的相关问题
已经有23人回复
细菌基因组的部分酶切
已经有16人回复
细菌基因组DNA的提取问题
已经有17人回复
细菌基因组DNA电泳图谱
已经有6人回复
细菌基因组DNA提取 交流
已经有18人回复
细菌全基因组提取求助
已经有7人回复
细菌基因组DNA的纯化方法?
已经有5人回复
【求助/交流】关于细菌基因组DNA提取的问题?
已经有5人回复
【求助/交流】提取细菌基因组DNA的试剂盒
已经有8人回复
【求助/交流】细菌基因组的单酶切问题
已经有4人回复
【求助/交流】如何构建细菌的基因组表达文库
已经有19人回复
【求助/交流】新菌鉴定 细菌基因组 GC 含量 哪里可以测?急急急急急急。。谢谢谢谢
已经有8人回复
【求助/交流】细菌基因组DNA提取试剂盒
已经有10人回复
【求助/交流】关于细菌 抗性 筛选 质粒基因 进入染色体基因组
已经有4人回复
【求助/交流】细菌基因组DNA的提取法(CTAB/NaCl 法),提取的DNA是否为细菌总DNA? 非�
已经有11人回复
【求助/交流】细菌基因组为模板做pcr的问题
已经有5人回复
【求助/交流】关于细菌基因组DNA大小的问题
已经有9人回复
【求助/交流】在提取细菌DNA基因组做为PCR模板时,如何保证各个DNA模板的浓度相近
已经有6人回复
★
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2013-03-18 16:53:52
6楼2013-03-18 16:59:53
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
suyouzhen: 金币+10, 谢谢! 2013-03-18 19:57:31
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
suyouzhen: 金币+10, 谢谢! 2013-03-18 19:57:31
|
http://mall.cnki.net/magazine/Article/JCXK201107005.htm http://www.majorbio.com/Products/Genome_Detailed |
8楼2013-03-18 17:33:41
11楼2013-03-18 18:01:27
14楼2013-03-19 22:17:38
15楼2013-03-21 01:11:30
18楼2013-03-21 10:24:27
★
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
| 网上看到一份文件,按照此方法,今天刚在NCBI上传完一份细菌的全基因组,当然文件可能有些旧,有些选项与网站上的不一样,不过大部分是一样的,不影响参考学习,供大家学习! |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 细菌基因组数据上传.pdf
2018-06-07 22:53:24, 932.87 K
19楼2018-06-07 22:53:30
简单回复
haixiawu2楼
2013-03-18 13:00
回复
2013-03-18 16:41
回复
2013-03-18 16:56
回复
祝福祝福!!!
乾坤智林7楼
2013-03-18 17:05
回复
@_@ [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
neu2349楼
2013-03-18 17:41
回复
djt10楼
2013-03-18 17:43
回复
qqq99823612楼
2013-03-18 18:16
回复


Lopemann13楼
2013-03-18 18:18
回复
readytogo16楼
2013-03-21 07:24
回复
wingtaizho17楼
2013-03-21 08:26
回复










回复此楼