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suyouzhen

铁杆木虫 (小有名气)

应助: 9 (幼儿园)
金币: 6314.1
帖子: 226
在线: 148.3小时
虫号: 1859678

[交流] 求助细菌基因组组装

咨询一下做这方面的高手。我现在从原始的数据中（宏基因组测序）中找到了属于一个细菌的contigs，然后跟另一个已发表的同种细菌的全基因组做比对，发现了大概几百个的gaps。现在的问题就是我怎么去快速的去填补这些gaps，把contigs拼接好？有没有这方面的辅助软件可以用？显然手工去定位这些gaps好慢。有用的答案定重谢！

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1楼 2013-03-17 18:56:46

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hongrunge

铁杆木虫 (小有名气)

应助: 4 (幼儿园)
金币: 7992.1
帖子: 286
在线: 272.9小时
虫号: 584934

★ ★ ★
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
suyouzhen: 金币+2 2013-03-21 01:10:20

知网上近些年有很多关于全基因组测序和分析的博硕士论文，楼主不妨搜一下看看，祝好运！

14楼2013-03-19 22:17:38

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 19 个回答

userhung

禁虫 (文学泰斗)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
suyouzhen(金币+1): 谢谢参与
suyouzhen: 金币+10, 谢谢！ 2013-03-18 19:57:31

http://mall.cnki.net/magazine/Article/JCXK201107005.htm
http://www.majorbio.com/Products/Genome_Detailed

8楼2013-03-18 17:33:41

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

简单回复

乾坤智林7楼

2013-03-18 17:05 回复

suyouzhen(金币+1): 谢谢参与

@_@ [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

qqq99823612楼

2013-03-18 18:16 回复

suyouzhen(金币+1): 谢谢参与

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