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追寻风轻扬

金虫 (小有名气)

[求助] 重新合成的内参引物有引物二聚体该咋办? 已有1人参与

最近在做荧光定量PCR,我之前合成的内参引物扩增样品效果还行,引物二聚体很少。后来内参引物用完了,重新合成了两管,结果再扩增,引物二聚体就很多了。做了温度梯度PCR,从57度到64度,各个温度都有引物二聚体。请问这是怎么回事呢?我的反应体系是10ul,引物加了0.5ul,模板1ul,引物浓度时10umol/L的。今天把引物稀释了4倍、16倍、32倍、64倍,结果只有稀释四倍的扩增出条带,但是还有引物二聚体。请问在不重新合成引物的情况下,还可以怎么调整条件?
PS:荧光定量的产物都是挺小的,最大也就200bp左右,我用的反应程序里面72度延伸时间是45秒,请问这会不会导致产引物二聚体增加?减少延伸时间可行吗?减少退火时间呢?
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幸福只道是寻常
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zhaiaguan

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

最好是重新合成引物吧,有引物二聚体的CT值没有可靠性
2楼2014-03-18 16:04:40
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

2次的引物序列一样吗?
3楼2014-03-18 16:51:51
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