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QPCR扩增效率太低
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shiliyusly
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虫号: 1434769
[交流]
QPCR扩增效率太低
大家好,我做QPCR基因扩增效率的时候,一个基因由于CT太大,所以只进行4个2倍的稀释度,二步法退火温度是61度扩增效率不高只有78%(图1)溶解曲线(图3),所以我做了三步法退火温度59度扩增效率反而更低了只有57%(图2)溶解曲线(图4),很奇怪,请教下大家看这是什么原因,该怎么改进呢?有看到资料说把引物浓度提高,不知道效果怎样。
图1.jpg
图2.jpg
图3.jpg
图4.jpg
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cicelyzh
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2013-02-26 23:05:23
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cicelyzh
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11楼
:
Originally posted by
shiliyusly
at 2013-02-28 15:47:52
刚才我把这个基因做扩增效率的4个浓度中最小浓度去掉了(CT值39),就剩了3个浓度的扩增效率有102%了,溶解曲线图和扩增效率曲线如下图:
A8NV9Y92791ETS2])((LB`G.jpg
(DVP632Y0]JBHW){}E`_H8H.jp ...
CT值在35以上的一般不要用,尽量弄在30以下,实在不行的话33以下。模板浓度很稀的情况,PCR的效率无法接近100%,也就是说增加一个循环,产物浓度不是原来的2倍。
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12楼
2013-03-01 00:37:22
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★
shiliyusly(金币+1): 谢谢参与
应该是引物不合适
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2楼
2013-02-27 09:40:24
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chenyuqin
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★
shiliyusly(金币+1): 谢谢参与
分析一下你的基因,拷贝数怎么样,可以增加循环数
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3楼
2013-02-27 12:57:32
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cicelyzh
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★
shiliyusly(金币+1): 谢谢参与
基因丰度不够,CT数太大造成的。如果样品的CT值过高定量也不准确。你可以试试加大模板用量,或者逆转录时在反应体系中加入目的基因特异性3'引物。
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shiliyusly
4楼
2013-02-27 13:27:56
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