24小时热门版块排行榜

返回列表

budinggguodu

金虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 640.3
帖子: 20
在线: 40.1小时
虫号: 2199570
注册: 2012-12-21
专业: 基础兽医学

[求助] 求助测序得到条带NCBI上没有同源序列

如题我是同源克隆得到测序结果以后 NCBI上没有同源条带并且送去测序了两个样品结果都不一样。。。虽然决定试验要重新做了但是还是想看看有没有虫友们帮忙解释一下本人新虫谢谢大家~

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

急！NCBI的使用和进化树构建求助已经有4人回复
转化后菌液PCR鉴定，没有目的条带已经有15人回复
已经克隆测序到了matK序列，如何界定？急切求助中，谢谢！已经有10人回复
功能基因扩增相关已经有14人回复
用PCR扩增后的DNA如何测序？不能直接用PCR就知道是什么菌种之类的吧？已经有6人回复
同源比对设计简并引物PCR产物测序不符！已经有10人回复
菜鸟求助——着急求助解答：在NCBI上为什么下载不了FASTA格式的基因序列已经有9人回复
NCBI中新序列的登录号怎么获取？已经有9人回复
【求助/交流】如何从GENBANK上查询菌株的的Acession No 已经有5人回复
【求助/交流】我做了SSH，测序了400个。反转录序列与NCBI比对还用将其反向吗已经有3人回复
【求助/交流】NCBI上注册基因序列，没有ACCESSION NUMEBER是怎么回事？谢谢已经有6人回复
【求助/交流】PCR产物测序总是不对已经有13人回复
【求助/交流】关于基因序列比对已经有6人回复
【求助/交流】关于ncbi上比对结果的问题已经有6人回复
【求助/交流】怎样在一段序列中查找可能的测序引物？已经有4人回复
【求助/交流】求助基因克隆方面的问题解决方案已经有17人回复

1楼 2013-02-14 22:15:29

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

keydy

木虫 (小有名气)

应助: 6 (幼儿园)
金币: 2618.1
帖子: 55
在线: 35.3小时
虫号: 298281
注册: 2006-11-19
性别: GG
专业: 生物化学

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
budinggguodu: 金币+1, ★有帮助, 谢谢样品是阳性克隆嗯这个物种的序列不知道和它同一个属的知道了序列比较了一下相似性几乎没有出来的条带肯定是不对我就挺费解怎么出来的条带。。 2013-02-16 19:03:51
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助，新年快乐 2013-02-17 13:33:17

分析一下可能的原因：
1.测序结果是否可靠？如果不是，可以重测看看；
2.是检测的阳性克隆吗？这个是必要条件；
3.NCBI上的"同源条带"是指什么？这段基因序列在克隆前是已知的吗？如果已知，那么可以手动对比一下序列间的差异到底在哪里；
4.诺贝尔奖在召唤你（开玩笑的）。

赞一下

回复此楼

2楼2013-02-15 11:54:34

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

柠檬果果

铜虫 (初入文坛)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 453.9
红花: 1
帖子: 26
在线: 24.1小时
虫号: 1338290
注册: 2011-07-05
性别: MM
专业: 水产基础生物学

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
budinggguodu: 金币+1, ★有帮助, 怎么判断测序出了问题呢设计引物是根据和它一个属的其他细菌同功能蛋白序列保守序列合成的 2013-02-16 19:06:46
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助，新年快乐 2013-02-17 13:33:33

说下我的看法，其实跟楼上基本相同
1.测序出问题了，看看引物设计的是否正确，根据什么序列设计的引物
2.你测的是什么的序列，找到同一物种的序列跟测序的结果进行一下比对，看有没有相似的序列，有的话看看相似性多少，看看测序的结果是否准确

赞一下

回复此楼

没有如果。。