24小时热门版块排行榜    

查看: 1954  |  回复: 8

budinggguodu

金虫 (初入文坛)

[求助] 求助 测序得到条带NCBI上没有同源序列

如题 我是同源克隆 得到测序结果以后 NCBI上没有同源条带 并且送去测序了两个样品 结果都不一样。。。虽然决定试验要重新做了 但是还是想看看有没有虫友们帮忙解释一下 本人新虫 谢谢大家~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

keydy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
budinggguodu: 金币+1, 有帮助, 谢谢 样品是阳性克隆 嗯 这个物种的序列不知道 和它同一个属的知道了序列 比较了一下相似性几乎没有 出来的条带肯定是不对我就挺费解怎么出来的条带。。 2013-02-16 19:03:51
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助,新年快乐 2013-02-17 13:33:17
分析一下可能的原因:
1.测序结果是否可靠?如果不是,可以重测看看;
2.是检测的阳性克隆吗?这个是必要条件;
3.NCBI上的"同源条带"是指什么?这段基因序列在克隆前是已知的吗?如果已知,那么可以手动对比一下序列间的差 异到底在哪里;
4.诺贝尔奖在召唤你(开玩笑的)。
2楼2013-02-15 11:54:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬果果

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
budinggguodu: 金币+1, 有帮助, 怎么判断测序出了问题呢 设计引物是根据和它一个属的其他细菌同功能蛋白序列保守序列合成的 2013-02-16 19:06:46
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助,新年快乐 2013-02-17 13:33:33
说下我的看法,其实跟楼上基本相同
1.测序出问题了,看看引物设计的是否正确,根据什么序列设计的引物
2.你测的是什么的序列,找到同一物种的序列跟测序的结果进行一下比对,看有没有相似的序列,有的话看看相似性多少,看看测序的结果是否准确
没有如果。。
3楼2013-02-15 21:23:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robustli

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励,新年快乐 2013-02-17 13:33:54
非特异性扩增,或引物有问题,或PCR条件需优化,在送出阳性克隆钱,可以用二次巢式PCR确定是否是你要的产物
immunologyparasite
4楼2013-02-16 01:15:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

budinggguodu

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by robustli at 2013-02-16 01:15:14
非特异性扩增,或引物有问题,或PCR条件需优化,在送出阳性克隆钱,可以用二次巢式PCR确定是否是你要的产物

嗯 谢谢 下次可以试试 用两对引物试试
5楼2013-02-16 19:08:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alarace

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励,新年快乐 2013-02-17 13:34:10
有时候测序结果出问题,可能把载体信息测出来了,所以,看看所测结果是否和所用载体序列有同源性吧。
6楼2013-02-16 23:36:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

可以基本确定,测序错误,现在的测序公司很乱。很多时候都测不出来。。
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
7楼2013-04-26 20:40:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

budinggguodu

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 416114799 at 2013-04-26 20:40:50
可以基本确定,测序错误,现在的测序公司很乱。很多时候都测不出来。。

这个应该不会吧
8楼2013-04-30 11:38:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by budinggguodu at 2013-04-30 11:38:20
这个应该不会吧...

谁说不会啊?很多时候公司就是测不出来。说不定结果页造假呢!!
不过,祝福你,希望你是发下了新物种。。呵呵
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
9楼2013-04-30 11:40:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 budinggguodu 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 5/250 2026-08-31 14:40 by hahaboy
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +6 雨打竹帘 2026-08-30 10/500 2026-08-31 09:29 by huixian257
[基金申请] 面上意见出来了 +10 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 19/950 2026-08-31 08:01 by blueearth171
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
信息提示
请填处理意见