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amynihao

金虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 361.1
帖子: 443
在线: 230.7小时
虫号: 941269

[交流] MS中把两种分子放到一起的建模方法有几种。

我知道一种就是利用AC模块，根据两种分子的添加比例加入进去。适合建立熔融体系或者溶液体系等充分混合体系的模型，各位虫友还能提供其他的建模方法吗？

[ 来自科研家族寂寞大虫家族 ]

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1楼2013-01-23 14:16:12

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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

使用packmol把几种分子添加到一起，形成的PDB 文件，也能导入到MS吧？

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2楼2013-01-23 14:19:57

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孤独中生存

银虫 (正式写手)

应助: 9 (幼儿园)
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虫号: 1765102

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流，最好验证一下吧，实验出真知嘛 2013-01-23 15:53:36

直接复制，粘贴，再几何优化也不妨一种方法（师姐教的，还没验证）

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3楼2013-01-23 15:24:01

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