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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

[求助] Materials studio模拟聚合物红外光谱图

怎样用Materials studio模拟聚合物红外光谱图!我想模拟两聚合物(如图)混合后的红外光谱图,请问大家应怎样操作?

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aoteman6

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
wangyiyongwz: 回帖置顶 2012-04-16 09:21:37
zh1987hs: 金币+5, 鼓励讨论 2012-04-16 15:06:39
用dmol模块计算频率,calculate里设置参数,性质里勾选frequency。
计算成功会有.hesswk文件的
导出光谱的方法:在tool里选择vibrational analysis。这时出来如图1,这时caculation按钮应该是灰的,点edit  insert from 选择你算到的.hessian ,这时图一中的caculation按钮为可以按的了,点击caculation,然后出现图2,然后点击下面的三个按钮就可以得到数据和光谱了。





» 本帖已获得的红花(最新10朵)

11楼2012-04-13 11:42:40
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

aoteman6

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
zh1987hs: 金币+3, 鼓励热心应助。。但是楼主的自觉性貌似有点弱。。。 2012-04-06 13:57:35
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangyiyongwz at 2012-04-06 08:41:39:
具体的MS上的操作步骤呢??

什么意思?这个。。。
在MS画好这个分子,这个是聚合物的话可以用build  polymer建模,具体的怎么建你自己看咯。。。
建好了模型,就可以用dmol模块,calculate里设置参数,性质里勾选frequency,投作业就可以了啊。。。
6楼2012-04-06 13:23:53
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aoteman6

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-04-05 10:52:46
wangyiyongwz: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-04-09 09:01:49
红外光谱图可以大致确官能团的类型,为什么不分开模拟?
2楼2012-04-03 21:05:15
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aoteman6

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-04-05 16:37:33
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangyiyongwz at 2012-04-05 09:16:29:
怎样分开呢?详解

用dmol模块,计算频率不就得到红外了吗?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-04-05 14:14:55
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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by aoteman6 at 2012-04-13 11:42:40:
用dmol模块计算频率,calculate里设置参数,性质里勾选frequency。
计算成功会有.hesswk文件的
导出光谱的方法:在tool里选择vibrational analysis。这时出来如图1,这时caculation按钮应该是灰的,点edit  ins ...

不好意思还想问一下,这些参数又应该怎样设置呢,例如task等等?


14楼2012-04-16 11:26:40
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aoteman6

银虫 (小有名气)

一般看你需要什么,我一般先结构优化一下,然后再计算其他的性质
这位大侠。。。你可以看一下帮助文件。。。
15楼2012-04-16 14:05:52
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普通回帖

wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by aoteman6 at 2012-04-03 21:05:15:
红外光谱图可以大致确官能团的类型,为什么不分开模拟?

怎样分开呢?详解
3楼2012-04-05 09:16:29
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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by aoteman6 at 2012-04-05 14:14:55:
用dmol模块,计算频率不就得到红外了吗?

具体的MS上的操作步骤呢??
5楼2012-04-06 08:41:39
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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by aoteman6 at 2012-04-06 13:23:53:
什么意思?这个。。。
在MS画好这个分子,这个是聚合物的话可以用build  polymer建模,具体的怎么建你自己看咯。。。
建好了模型,就可以用dmol模块,calculate里设置参数,性质里勾选frequency,投作业就可以 ...

首先,非常感谢,另外我还想问一下,像模拟这两个聚合物,周期边界应该怎样设置,比如a,b,c  和密度应该怎样设置,两种分子数应该放多少?
7楼2012-04-09 09:05:28
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aoteman6

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wangyiyongwz at 2012-04-09 09:05:28:
首先,非常感谢,另外我还想问一下,像模拟这两个聚合物,周期边界应该怎样设置,比如a,b,c  和密度应该怎样设置,两种分子数应该放多少?

这个应该去找文献看了,看别人怎么做的再自己根据自己的需求自己改进
8楼2012-04-09 15:39:57
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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by aoteman6 at 2012-04-09 15:39:57:
这个应该去找文献看了,看别人怎么做的再自己根据自己的需求自己改进

另外我还想问问:水分子的数目是不是一定要根据溶液的密度来加?如果按照密度来加水分子,我的模拟体系有8000个左右的水分子!是不是太多了?
9楼2012-04-11 08:50:13
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summerqr

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by aoteman6 at 2012-04-05 14:14:55:
用dmol模块,计算频率不就得到红外了吗?

用dmol模块计算频率一般怎么设置呢?
好象一直没有反应,也没有出现任何图谱啊!!
10楼2012-04-12 23:11:32
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