应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】请问如何利用MS计算水溶液中两种分子之间的作用力，分析分子间距离。
121/2返回列表12下一页
查看: 3111  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zodlee

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请问如何利用MS计算水溶液中两种分子之间的作用力，分析分子间距离。 已有7人参与

查看了帖子，查看了文献~，查看了帮助

大约是我才疏学浅，看不到门路，找不到方向

只知道大约是使用DISCOVERY模块来做。

大致情况如下

模已建好

水溶液中，溶解了几种分子（或者离子）

那么，如何计算这几种分子或者离子之间的作用力呢？

另外，想知道几个分子之间的距离，应该如何做呢？

[ Last edited by zodlee on 2010-12-6 at 07:32 ]
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Kiki.Hugh

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-12-04 22:42:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
也有这方面的疑问  同求哈
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-12-04 23:46:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)
★
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-05 09:02:44
个人建议：
引用回帖:
DPD
Dissipative Particle Dynamics (DPD) is a mesoscale simulation program. It provides a dynamics algorithm with hydrodynamics for studying coarse-grained systems over long length and time scales. It also enables you to perform analyses on the results of such dynamics simulations.

DPD is quite general in applicability. The effective pair potentials are both short range and soft, allowing long dynamics time steps to be used. Since the DPD equation of state does not include cubic density terms, the potential does not produce a van der Waals loop in the pressure. As a result, liquid and vapor phases cannot coexist and only a single, fluid phase is obtained. The softness of the potential precludes crystalline phases. Walls can be included to study preferential adsorption and the system may be sheared to observe morphological changes.
回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
3楼2010-12-05 03:00:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zodlee

银虫 (小有名气)
恩，除了DPD还有其他模块么？
赞一下 回复此楼
4楼2010-12-06 07:33:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mountwar

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-12-06 16:23:49
本帖内容被屏蔽
5楼2010-12-06 16:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zodlee

银虫 (小有名气)
是否有更直观的可以直接获得

A on B，A on A，B on A 的作用力或者作用能的方法？
赞一下 回复此楼
6楼2010-12-07 14:12:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mountwar

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽
7楼2010-12-08 22:01:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-08 23:18:46
引用回帖:
Originally posted by mountwar at 2010-12-08 22:01:13:

楼主，问下你是通过哪个模块建模的，谢谢了！

楼上有人回答了，用amorhpous cell构建（construction），然后进行MD模拟（我用的是discover模块）
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2010-12-08 22:59:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mountwar

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽
9楼2010-12-09 07:50:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Kiki.Hugh

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
楼主你好，我想请教你是怎么将离子融入水溶液的呢？我用amorhpous cell构建（construction），我已给离子分配了力场和电荷。结果fail了，说不能在其中加入atom。
赞一下 回复此楼
10楼2014-10-28 23:26:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zodlee 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 鹤遨予卿 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:44 by JourneyLucky
[考研] 一志愿天津大学，英一数二305分求调剂，四六级已过 +8 小小番的茄 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:53 by JourneyLucky
[考研] 求调剂！ +4 朔朔话 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:38 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中农业大学071010，总分三百二,求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:35 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分，求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] （081700）化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生，2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 283求调剂，材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 0857环境调剂 +5 熠熠_11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 10:59 by wang_dand
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭