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[求助] DNA分子stem-loop形成条件

求助：我设计了一条单链DNA，用idt分析可以形成分子内的stem-loop结构，TM：66.3但是我实验时就是形成不了stem-loop结构，请哪位大神指点

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1楼 2012-12-21 14:49:49

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8楼: Originally posted by greeneese at 2012-12-22 10:52:55
这就是你用IDT模拟不出问题的原因所在，因为他们的模拟引擎不考虑四分体的形成，而实际上四分体和茎环结构之间是构成竞争关系的。...

可是文献上就又报道将G四分体隐藏在stem-loop中，加入hemin后与单纯只有hemin催化ABTS变色差的不多，说明茎环结构的结合比四分体的结合强而我的茎环结构比别人的强但是还是做不出来

9楼2012-12-22 14:34:29

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greeneese

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

方便不方便透露你设计的具体序列，以及具体操作步骤和条件？

2楼2012-12-21 17:34:16

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greeneese

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以及你如何判定的没有形成茎环结构？

3楼2012-12-21 17:34:55

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引用回帖:

2楼: Originally posted by greeneese at 2012-12-21 17:34:16
方便不方便透露你设计的具体序列，以及具体操作步骤和条件？

GGA GAG GGG TAG GGC GGG TTG GGC CCC TCT CCC CTG CTG CT
在Tris-HAC 缓冲 pH7.4 含Na K Mg等离子
90度加热10min 缓慢冷却至25度在25度下2h

4楼2012-12-21 20:44:13

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