应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 化学分析 » DNA分子stem-loop形成条件
151/2返回列表12下一页
查看: 2100  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

890528

新虫 (初入文坛)

[求助] DNA分子stem-loop形成条件

求助：我设计了一条单链DNA，用idt分析可以形成分子内的stem-loop结构，TM：66.3但是我实验时就是形成不了stem-loop结构，请哪位大神指点
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-12-21 14:49:49
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
方便不方便透露你设计的具体序列，以及具体操作步骤和条件？
赞一下 回复此楼
2楼2012-12-21 17:34:16
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greeneese

铁杆木虫 (正式写手)
以及你如何判定的没有形成茎环结构？
赞一下 回复此楼
3楼2012-12-21 17:34:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

890528

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by greeneese at 2012-12-21 17:34:16
方便不方便透露你设计的具体序列，以及具体操作步骤和条件？

GGA GAG GGG TAG GGC GGG TTG GGC CCC TCT CCC CTG CTG CT
在Tris-HAC 缓冲 pH7.4 含Na K Mg等离子
90度加热10min 缓慢冷却至25度 在25度下2h
赞一下 回复此楼
4楼2012-12-21 20:44:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

890528

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by greeneese at 2012-12-21 17:34:55
以及你如何判定的没有形成茎环结构？

加入hemin 用ABTS H2O2 显色 变很深的绿色
而只有hemin ABTS变色 绿色很浅
赞一下 回复此楼
5楼2012-12-21 20:48:48
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 890528 at 2012-12-21 20:44:13
GGA GAG GGG TAG GGC GGG TTG GGC CCC TCT CCC CTG CTG CT
在Tris-HAC 缓冲 pH7.4 含Na K Mg等离子
90度加热10min 缓慢冷却至25度 在25度下2h...

我觉得这是关键所在，有这么多的G碱基好像容易形成四分体结构。
赞一下 回复此楼
6楼2012-12-22 00:02:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

890528

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by greeneese at 2012-12-22 00:02:10
我觉得这是关键所在，有这么多的G碱基好像容易形成四分体结构。...

我设计的目的就是把G四分体包含在stem-loop中 从而把G四分体隐藏起来 有目标物时再打开  很多文献上有这样的报道 可是我就是做不出来
赞一下 回复此楼
7楼2012-12-22 10:13:11
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 890528 at 2012-12-22 10:13:11
我设计的目的就是把G四分体包含在stem-loop中 从而把G四分体隐藏起来 有目标物时再打开  很多文献上有这样的报道 可是我就是做不出来...

这就是你用IDT模拟不出问题的原因所在，因为他们的模拟引擎不考虑四分体的形成，而实际上四分体和茎环结构之间是构成竞争关系的。
赞一下 回复此楼
8楼2012-12-22 10:52:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

890528

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by greeneese at 2012-12-22 10:52:55
这就是你用IDT模拟不出问题的原因所在，因为他们的模拟引擎不考虑四分体的形成，而实际上四分体和茎环结构之间是构成竞争关系的。...

可是文献上就又报道将G四分体隐藏在stem-loop中，加入hemin后与单纯只有hemin催化ABTS变色差的不多，说明茎环结构的结合比四分体的结合强 而我的茎环结构比别人的强 但是还是做不出来
赞一下 回复此楼
9楼2012-12-22 14:34:29
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 890528 at 2012-12-22 14:34:29
可是文献上就又报道将G四分体隐藏在stem-loop中，加入hemin后与单纯只有hemin催化ABTS变色差的不多，说明茎环结构的结合比四分体的结合强 而我的茎环结构比别人的强 但是还是做不出来...

什么文献？能否共享一下引用条目？
赞一下 回复此楼
10楼2012-12-29 12:23:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 890528 的主题更新
151/2返回列表12下一页
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 7/350 2026-08-19 10:48 by bugaboo
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +10 基诺咪客 2026-08-17 14/700 2026-08-19 10:34 by 基诺咪客
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +7 kkkl_v 2026-08-19 7/350 2026-08-19 10:28 by pfeng
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +4 ziyangfang 2026-08-19 4/200 2026-08-19 10:23 by JChen2024
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +8 启萌科技 2026-08-12 30/1500 2026-08-19 10:22 by 启萌科技
[基金申请] 今天放榜吗？ +11 布布和一二 2026-08-19 11/550 2026-08-19 10:06 by xter9665
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +4 Tide man 2026-08-12 5/250 2026-08-19 07:41 by 201120518022
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 9/450 2026-08-18 20:09 by 奶牛小黑
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭