应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » DNA怎样形成发夹结构
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
191/1返回列表
查看: 16178  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chenwu9987

银虫 (小有名气)

[交流] DNA怎样形成发夹结构

最近买了一条DNA链，5’-TexasRed-Sample TextCGATGCGGAAAGAAGGSample Text-3’
想问一下，DNA链本身在水溶液中会自发形成发夹结构吗？会不会形成二聚体呢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-07-05 15:29:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gelois

金虫 (正式写手)
★ ★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-07-06 13:49:51
一般储存情况下是不会形成发卡结构的，只有在PCR过程中，退火的时候，如果自身有发卡结构的话会比较容易形成。所以在PCR的时候要注意退火温度。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-07-05 16:09:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

chenwu9987

银虫 (小有名气)
写错了，DNA链中红色字体应分别为TTTTTT           AAAAAA
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-05 15:30:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhyzx

金虫 (小有名气)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
高温退火就行
回复此楼
3楼2012-07-05 15:45:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenwu9987

银虫 (小有名气)
不退火是不是就无法形成啊
赞一下 回复此楼
4楼2012-07-05 15:57:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黄小剑

木虫 (正式写手)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
当然会了，T和A是配对的，可以自身配对形成发夹结构，也可以和另一条DNA配对
赞一下 回复此楼
6楼2012-07-05 16:10:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

君子婷

银虫 (小有名气)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
会的。提高退火温度，不然跑胶的时候会看到引物二聚体。
赞一下 回复此楼
7楼2012-07-05 20:52:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenwu9987

银虫 (小有名气)
发夹结构是不是只有在PBS缓冲液中形成啊在水中无法形成，怎样判断是否形成发夹结构了呢
赞一下 回复此楼
8楼2012-07-06 09:33:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xingyanfei

金虫 (正式写手)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
有，作模拟的吗？用模拟时，如何将单链弄成发卡结构
赞一下 回复此楼
9楼2012-07-06 10:42:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bbwalkman

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流经验 2012-07-06 13:50:09
1.其实这就有点类似于分子信标的结构了呢，分子信标要形成这种茎环结构，还是要有一定的盐离子浓度的，Na+，K+等等，在水中也有可能会有一部分形成茎环结构的。
2.有没有二聚体或者发卡结构可以去idt的网站上测试一下，看看dimer和Tm值什么的。
3.不知道你定的这条链要干什么，如果是想要形成发卡结构的话，那就用之前高温加热一下，然后缓慢降到室温，这样可以减少两条链之间的杂交。
4.如果不想要的话，那可能据需要根据你的实验，选择一个合适的反应温度，不过用之前加热一下可能会比较好。

祝好运
赞一下 回复此楼
10楼2012-07-06 10:53:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenwu9987

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by bbwalkman at 2012-07-06 10:53:06
1.其实这就有点类似于分子信标的结构了呢，分子信标要形成这种茎环结构，还是要有一定的盐离子浓度的，Na+，K+等等，在水中也有可能会有一部分形成茎环结构的。
2.有没有二聚体或者发卡结构可以去idt的网站上测试一 ...

我想要这条链自身在溶液中形成发夹结构，之后再加入一条和这条链中间黑色碱基配对的DNA，杂交，是发夹结构解开，释放出碱基5’端的TTTTTT。  因为DNA杂交一般都是先升温在降温，所以我以为同样的方法处理上述DNA链的话会不会更多的形成二聚体呢
赞一下 回复此楼
11楼2012-07-06 11:01:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蝈蝈1988

木虫 (小有名气)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
貌似可以。。你尝试的结果是？？？
赞一下 回复此楼
12楼2012-07-06 11:28:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

healy13

禁虫 (小有名气)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
13楼2012-07-06 12:18:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
本帖仅楼主可见
赞一下
14楼2012-07-06 14:18:33
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

bbwalkman

木虫 (小有名气)
★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-07 13:38:33
引用回帖:
11楼: Originally posted by chenwu9987 at 2012-07-06 11:01:53
我想要这条链自身在溶液中形成发夹结构，之后再加入一条和这条链中间黑色碱基配对的DNA，杂交，是发夹结构解开，释放出碱基5’端的TTTTTT。  因为DNA杂交一般都是先升温在降温，所以我以为同样的方法处理上述DNA链 ...

那这就和分子信标的原理一样了，你可以看看关于分子信标的相关文献，谭蔚泓做的好像还是比较地道的，那你如果怕链和链之间有杂交的话，那就先高温加热几分钟，一般是95℃就可以了，然后缓慢降到室温待一阵，再加入你的Target，这样做还是比较好的，如果条件允许的话（可以适当加一部分你的酶反应Buffer，如果没有就算了），有一定的盐离子浓度还是有助于闭环的。
赞一下 回复此楼
15楼2012-07-06 17:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neu234

木虫之王 (文学泰斗)
★
chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
应该差不多
回复此楼
16楼2012-07-07 09:46:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈莹

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
14楼: Originally posted by 大-木-虫 at 2012-07-06 14:18:33
打断一下，高温之后是不是应该快速降温呀？...

我也想这样问一下，我处理的也是缓慢降低到室温，可文献中都是1h内降到室温的，速度挺快，让我有颇多不解。
赞一下 回复此楼
17楼2014-08-11 10:54:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangliually

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by gelois at 2012-07-05 16:09:36
一般储存情况下是不会形成发卡结构的，只有在PCR过程中，退火的时候，如果自身有发卡结构的话会比较容易形成。所以在PCR的时候要注意退火温度。

根据IDT计算出退火温度，在降温的时候在退火温度+-5度范围内作梯度停留了一段时间，结果都一样，都有引物二聚体呀……
赞一下 回复此楼
18楼2015-07-12 17:13:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

咸鱼啊

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
17楼: Originally posted by 陈莹 at 2014-08-11 10:54:12
我也想这样问一下，我处理的也是缓慢降低到室温，可文献中都是1h内降到室温的，速度挺快，让我有颇多不解。...

想问一下这个缓慢降温是个要怎么降呀 感觉pcr里面降温挺快的
赞一下 回复此楼
19楼2018-07-20 10:30:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chenwu9987 的主题更新
191/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 320分人工智能调剂 +8 振—TZ 2026-04-03 8/400 2026-04-05 22:33 by 范式思维
[考研] 302分 085601求调剂推荐 +11 zyx上岸！ 2026-04-05 11/550 2026-04-05 22:13 by dongzh2009
[考研] 301求调剂 +3 细胞相关蛋白 2026-04-03 3/150 2026-04-05 21:07 by 学员8dgXkO
[考研] 338求调剂 +3 我想上岸ii 2026-04-05 3/150 2026-04-05 19:59 by nepu_uu
[考研] 308求调剂 +4 maverick^_^ 2026-04-03 4/200 2026-04-05 19:08 by 蓝云思雨
[考研] 298分 070300求调剂 +15 zwen03 2026-04-02 15/750 2026-04-05 12:52 by Hdyxbekcb
[考研] 考研调剂 +3 mcbbc 2026-04-04 3/150 2026-04-05 10:03 by barlinike
[考研] 一志愿华中农业大学0710（A）初试329分 求调剂 +4 一名26考研生 2026-04-04 4/200 2026-04-05 10:01 by barlinike
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 349求调剂 +11 zwjjjjjj 2026-03-31 11/550 2026-04-04 19:52 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿华南师范361分，化学求调剂 +7 Nicole88888 2026-04-01 7/350 2026-04-04 18:28 by macy2011
[考研] 本科211，专业085404，293分请求调剂 +5 莲菜就是藕吧 2026-04-04 5/250 2026-04-04 14:08 by 这是一个无聊的�
[考研] 英一数一408，总分284，二战真诚求调剂 +13 12.27 2026-03-30 15/750 2026-04-03 14:41 by 氮气气气
[考研] 一志愿北京交通大学材料工程总分358 +4 cs0106 2026-04-03 4/200 2026-04-03 13:41 by 百灵童888
[考研] 313求调剂 +3 ～微微凉～ 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:25 by 啵啵啵0119
[考研] 材料340分调剂 +7 夏夜晚风_long 2026-04-02 9/450 2026-04-02 21:20 by dongzh2009
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
[考研] 261求B区调剂 +5 明仔· 2026-04-01 7/350 2026-04-02 11:17 by 邹尉尉
[考研] 食品学硕362求调剂 +3 xuanxianxian 2026-04-01 3/150 2026-04-01 21:05 by 啊李999
[考研] 318求调剂 +10 陈晨79 2026-03-30 10/500 2026-03-31 17:37 by 544594351
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭