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chenwu9987

银虫 (小有名气)

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[交流] DNA怎样形成发夹结构

最近买了一条DNA链，5’-TexasRed-Sample TextCGATGCGGAAAGAAGGSample Text-3’
想问一下，DNA链本身在水溶液中会自发形成发夹结构吗？会不会形成二聚体呢

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1楼 2012-07-05 15:29:23

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bbwalkman

木虫 (小有名气)

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chenwu9987(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流经验 2012-07-06 13:50:09

1.其实这就有点类似于分子信标的结构了呢，分子信标要形成这种茎环结构，还是要有一定的盐离子浓度的，Na+，K+等等，在水中也有可能会有一部分形成茎环结构的。
2.有没有二聚体或者发卡结构可以去idt的网站上测试一下，看看dimer和Tm值什么的。
3.不知道你定的这条链要干什么，如果是想要形成发卡结构的话，那就用之前高温加热一下，然后缓慢降到室温，这样可以减少两条链之间的杂交。
4.如果不想要的话，那可能据需要根据你的实验，选择一个合适的反应温度，不过用之前加热一下可能会比较好。

祝好运