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chenwu9987

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[交流] DNA怎样形成发夹结构

最近买了一条DNA链，5’-TexasRed-Sample TextCGATGCGGAAAGAAGGSample Text-3’
想问一下，DNA链本身在水溶液中会自发形成发夹结构吗？会不会形成二聚体呢

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1楼 2012-07-05 15:29:23

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bbwalkman

木虫 (小有名气)

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小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-07 13:38:33

引用回帖:

11楼: Originally posted by chenwu9987 at 2012-07-06 11:01:53
我想要这条链自身在溶液中形成发夹结构，之后再加入一条和这条链中间黑色碱基配对的DNA，杂交，是发夹结构解开，释放出碱基5’端的TTTTTT。因为DNA杂交一般都是先升温在降温，所以我以为同样的方法处理上述DNA链 ...

那这就和分子信标的原理一样了，你可以看看关于分子信标的相关文献，谭蔚泓做的好像还是比较地道的，那你如果怕链和链之间有杂交的话，那就先高温加热几分钟，一般是95℃就可以了，然后缓慢降到室温待一阵，再加入你的Target，这样做还是比较好的，如果条件允许的话（可以适当加一部分你的酶反应Buffer，如果没有就算了），有一定的盐离子浓度还是有助于闭环的。