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GJ_Thoreau

新虫 (初入文坛)

[求助] 有木有人知道“分离相似分子量的DNA分子的方法"呢?

本人在实验中用通用引物PCR出来了混合样中的多个相同分子量DNA(相同长度bp)的,通过电泳只是一个条带,所以将条带切胶回收后连接载体导入大肠杆菌,挑选单一菌落进行扩繁以分离出相同分子量但不同序列的DNA分子,但是该过程有些复杂,有木有知道简便方法可以分离相同分子量的DNA的呢?谢谢
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朱欢

银虫 (初入文坛)


西瓜(金币+1): Good!可否详细些呢? 2011-11-09 21:30:48
DGGE
2楼2011-11-09 21:22:52
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GJ_Thoreau

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
你好,我目的是要将PCR产物进行测序,但产物其实是不同序列构成的杂带(长度都一样)混合体,不能进行测序(有套峰),我是想能够通过简单的方法将长度相同但序列构成不一样的PCR产物分开,再测序
3楼2011-11-09 22:52:39
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朱欢

银虫 (初入文坛)

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★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+2): Good! 2011-12-15 22:28:18
克隆啊,再挑取单克隆pcr然后测序。。。
4楼2011-12-15 20:16:06
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cloverplm

金虫 (小有名气)

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感谢参与,应助指数 +1
denaturing gradient gel electrophoresis;DGGE
净——静——竞——进
5楼2011-12-15 22:51:41
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cloverplm

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): Good! 2011-12-15 23:45:11
denaturing gradient gel electrophoresis;DGGE
随着电泳凝胶中的变性剂浓度的增大,由双链DNA分子变性形成的单链分子的电泳迁移率发生变化。
双链DNA 分子在一般的聚丙烯酰胺凝胶电泳时,其迁移行为决定于其分子大小和电荷。不同长度的DNA 片段能够被区分开,但同样长度的DNA 片段在胶中的迁移行为一样,因此不能被区分。DGGE/TGGE 技术在一般的聚丙烯酰胺凝胶基础上,加入了变性剂(尿素和甲酰胺)梯度,从而能够把同样长度但序列不同的DNA 片段区分开来。一个特定的DNA 片段有其特有的序列组成,其序列组成决定了其解链区域(meltingdomain, MD)和解链行为(melting behavior) 。一个几百个碱基对的DNA 片段一般有几个解链区域,每个解链区域有一段连续的碱基对组成。当变性剂浓度逐渐增加达到其最低的解链区域浓度时,该区域这一段连续的碱基对发生解链。当浓度度再升高依次达到各其他解链区域浓度时,这些区域也依次发生解链。直到变性剂浓度达到最高的解链区域浓度后,最高的解链区域也发生解链,从而双链DNA 完全解链。
净——静——竞——进
6楼2011-12-15 22:52:44
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