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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于DNA弥散
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riqqqqdx

银虫 (小有名气)

[求助] 关于DNA弥散

提取土壤DNA用琼脂糖检测出现弥散，请问有哪些原因？多谢！
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鸟来吃虫
1楼2012-12-14 08:41:48
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kkmmkkmmkk

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
土壤本身是不含DNA的，从中提取的DNA应该是各种生物在土壤中的核酸残留。因此降解的核酸于此是合情合理的。甚至可能有些土壤样本中提取不到核酸。
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2楼2012-12-14 08:55:23
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riqqqqdx

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kkmmkkmmkk at 2012-12-14 08:55:23
土壤本身是不含DNA的，从中提取的DNA应该是各种生物在土壤中的核酸残留。因此降解的核酸于此是合情合理的。甚至可能有些土壤样本中提取不到核酸。

之前都能提取到，但改用试剂盒后发现此问题，就是想知道有哪些因素能使DNA发生断链或讲解？
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鸟来吃虫
3楼2012-12-14 09:38:01
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果用MO bio kit提取,是正常现象. 我的建议是,减少在vortexer上震荡时间,从10分钟减少到五分钟. smear现象会有一定的减少. 不过,DNA的smear并不会影响后续实验,可以给你看看我的图,smear非常严重. 目前跟我合作的实验室,不建议使用MO BIO提取DNA.

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请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
4楼2012-12-14 12:59:40
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lidanye

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有跟楼上一样的经历。不喜欢用Mo Bio kit提土壤DNA，基本上主条带偏小，且有smear，虽然提出来的DNA感觉比较干净
用传统方法提DNA效果较好，只是可能在PCR时得加点DMSO来消除残留腐植酸的不利影响
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5楼2012-12-14 23:09:13
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四裤全输123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
MP的fastspin会不会好一些呢~！我现在用的也是MO的power soil。震荡时间控制在10 min ，弥散现象不是很严重
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6楼2012-12-16 15:16:16
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riqqqqdx

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by kiruwa at 2012-12-14 12:59:40
如果用MO bio kit提取,是正常现象. 我的建议是,减少在vortexer上震荡时间,从10分钟减少到五分钟. smear现象会有一定的减少. 不过,DNA的smear并不会影响后续实验,可以给你看看我的图,smear非常严重. 目前跟我合作的实 ...

谢谢！
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鸟来吃虫
7楼2012-12-18 17:57:34
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