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riqqqqdx

银虫 (小有名气)

[求助] 关于DNA弥散

提取土壤DNA用琼脂糖检测出现弥散,请问有哪些原因?多谢!
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鸟来吃虫
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kkmmkkmmkk

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
土壤本身是不含DNA的,从中提取的DNA应该是各种生物在土壤中的核酸残留。因此降解的核酸于此是合情合理的。甚至可能有些土壤样本中提取不到核酸。
2楼2012-12-14 08:55:23
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riqqqqdx

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kkmmkkmmkk at 2012-12-14 08:55:23
土壤本身是不含DNA的,从中提取的DNA应该是各种生物在土壤中的核酸残留。因此降解的核酸于此是合情合理的。甚至可能有些土壤样本中提取不到核酸。

之前都能提取到,但改用试剂盒后发现此问题,就是想知道有哪些因素能使DNA发生断链或讲解?
鸟来吃虫
3楼2012-12-14 09:38:01
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果用MO bio kit提取,是正常现象. 我的建议是,减少在vortexer上震荡时间,从10分钟减少到五分钟. smear现象会有一定的减少. 不过,DNA的smear并不会影响后续实验,可以给你看看我的图,smear非常严重. 目前跟我合作的实验室,不建议使用MO BIO提取DNA.

12345.png

请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
4楼2012-12-14 12:59:40
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lidanye

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有跟楼上一样的经历。不喜欢用Mo Bio kit提土壤DNA,基本上主条带偏小,且有smear,虽然提出来的DNA感觉比较干净
用传统方法提DNA效果较好,只是可能在PCR时得加点DMSO来消除残留腐植酸的不利影响
5楼2012-12-14 23:09:13
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四裤全输123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
MP的fastspin会不会好一些呢~!我现在用的也是MO的power soil。震荡时间控制在10 min ,弥散现象不是很严重
6楼2012-12-16 15:16:16
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riqqqqdx

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by kiruwa at 2012-12-14 12:59:40
如果用MO bio kit提取,是正常现象. 我的建议是,减少在vortexer上震荡时间,从10分钟减少到五分钟. smear现象会有一定的减少. 不过,DNA的smear并不会影响后续实验,可以给你看看我的图,smear非常严重. 目前跟我合作的实 ...

谢谢!
鸟来吃虫
7楼2012-12-18 17:57:34
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