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Marado

金虫 (正式写手)


[交流] 重组质粒单双酶切结果一样,奇怪了的……

重组的表达质粒,上面只有一个BamH I与一个Not I,表达载体大小为将近5kb,目的片段700多点bp.
求解!序列是没有问题的,比对过了,没有突变.

酶切.jpg
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wccc

银虫 (小有名气)


★
Marado(金币+1): 谢谢参与
是不是酶有问题了?或者酶的buffer不对?换个酶切前后顺序试试吧……
3楼2012-12-06 13:39:45
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倾听世界0721

金虫 (小有名气)


★
Marado(金币+1): 谢谢参与
你确定只有一个BamHI酶切位点吗?这样看好像是有两个BamHI酶切位点,把你的序列放到WebCutter上看看试试,会不会漏掉了什么位点。
4楼2012-12-06 13:45:53
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Marado

金虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by 倾听世界0721 at 2012-12-06 13:45:53
你确定只有一个BamHI酶切位点吗?这样看好像是有两个BamHI酶切位点,把你的序列放到WebCutter上看看试试,会不会漏掉了什么位点。

非常确定!
5楼2012-12-06 14:09:35
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labbench

新虫 (小有名气)


★
Marado(金币+1): 谢谢参与
测序了再确定好不好!现在测序那么便宜~
6楼2012-12-06 14:28:02
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desheng101

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
Marado(金币+1): 谢谢参与
Marado: 金币+2 2012-12-06 16:23:20
按照楼主说得载体将近5000,目的700,你酶切条带倒是符合。单酶切和双酶切都一样是不是有一个酶没发挥作用?
7楼2012-12-06 15:05:18
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hzlatqh

银虫 (小有名气)


★ ★ ★
Marado(金币+1): 谢谢参与
Marado: 金币+2 2012-12-06 16:22:54
要是序列没错的话,那就是酶污染了?为什么不做一个NotI单酶切看看呢

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8楼2012-12-06 15:50:26
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Marado

金虫 (正式写手)


送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by hzlatqh at 2012-12-06 15:50:26
要是序列没错的话,那就是酶污染了?为什么不做一个NotI单酶切看看呢

果然酶污染了,换了一管,正常了
还是你回答的比较对头
9楼2012-12-06 16:21:57
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zhengli123

金虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我觉得可能是你的片段里有两个BamHI酶切位点,并且这两个位点的长度也大概在700bp左右
10楼2012-12-07 09:40:42
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Marado

金虫 (正式写手)


引用回帖:
10楼: Originally posted by zhengli123 at 2012-12-07 09:40:42
我觉得可能是你的片段里有两个BamHI酶切位点,并且这两个位点的长度也大概在700bp左右

是酶污染了………………两管酶被混了……
11楼2012-12-07 09:58:20
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吉林农大

木虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by Marado at 2012-12-06 16:21:57
果然酶污染了,换了一管,正常了
还是你回答的比较对头...

想请问一下,请问你BamH I和Not I用的是哪个公司的,后来进行的是双酶切吗,酶切效果理想吗,如果理想的话,我想请教一下,您的酶切体系是怎么设定的,还有温度是多少,时间是多长,谢谢了,我也用这两个酶切,可是遇到问题了,用的是Takara的酶!
12楼2013-04-04 10:58:41
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Marado

金虫 (正式写手)


引用回帖:
12楼: Originally posted by 吉林农大 at 2013-04-04 10:58:41
想请问一下,请问你BamH I和Not I用的是哪个公司的,后来进行的是双酶切吗,酶切效果理想吗,如果理想的话,我想请教一下,您的酶切体系是怎么设定的,还有温度是多少,时间是多长,谢谢了,我也用这两个酶切,可是 ...

我用的也是TAKARA的,酶切体系看是做验证还是做回收,一般做个20ul体系,酶都加0.5ul,质粒根据浓度加,温度37℃,一般4,5个小时就可以完全切开.
13楼2013-04-07 08:59:10
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吉林农大

木虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
13楼: Originally posted by Marado at 2013-04-07 08:59:10
我用的也是TAKARA的,酶切体系看是做验证还是做回收,一般做个20ul体系,酶都加0.5ul,质粒根据浓度加,温度37℃,一般4,5个小时就可以完全切开....

嗯,我也是切了好几个小时,但出现过杂带切割不完整的现象,它们公司的NOT I好像不怎么活
14楼2013-04-08 23:50:52
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Marado

金虫 (正式写手)


引用回帖:
14楼: Originally posted by 吉林农大 at 2013-04-08 23:50:52
嗯,我也是切了好几个小时,但出现过杂带切割不完整的现象,它们公司的NOT I好像不怎么活...

他们的NOT I有时候确实不太好用.
15楼2013-04-09 10:40:48
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小芳同学1113

新虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
什么原因呢  我跟你一样的情况
16楼2022-10-16 17:23:41
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简单回复
su-b082楼
2012-12-06 12:34   回复  
Marado(金币+1): 谢谢参与
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