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xiaoluoerer

新虫 (初入文坛)

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[求助] 系统进化树的构建

我现在有二十几种真菌DNA的ITS序列，需要进行聚类分析，构建进化树，请问构建进化树的序列是我自己的序列还是在NCBI上对比之后选取的最接近的序列

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1楼 2012-12-05 19:41:48

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黑藻先生

银虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★
xiaoluoerer: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-12-12 20:09:09

我不大明白你说的聚类分析
如果是要做树为标准当参照的话如果有标准就找NCBI的标准
如果是你自己的序列应该是用自己序列去做吧

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2楼2012-12-10 16:14:27

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zwl1314

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★
xiaoluoerer: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-12-12 20:09:16

我们做种群分析是用的是自己的序列，在NCBI中选一个近缘种做外群

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3楼2012-12-10 17:03:56

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